More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2519 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  100 
 
 		 146 aa  294  3e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  75.17 
 
 		 149 aa  232  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  74.32 
 
 		 148 aa  226  6e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  72.97 
 
 		 151 aa  226  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  73.15 
 
 		 149 aa  219  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  47.06 
 
 		 140 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  45.59 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  50.36 
 
 		 140 aa  123  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  45.59 
 
 		 140 aa  120  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  44.93 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  43.38 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  43.07 
 
 		 138 aa  113  6.9999999999999995e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  44.53 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  43.66 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  45.52 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  45.52 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  41.91 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  44.78 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  38.41 
 
 		 179 aa  101  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  44.19 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  39.86 
 
 		 154 aa  89.4  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  39.22 
 
 		 185 aa  84  7e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  31.33 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  42.59 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  34.46 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  40.91 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  33.33 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  37.41 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  39.81 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  33.11 
 
 		 202 aa  73.9  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  31.94 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  30.07 
 
 		 199 aa  67  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  30.22 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  30.95 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  30.95 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  32.54 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  33.33 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1378  ribosomal protein L13  33.83 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  32.37 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  31.39 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  32.54 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  32.54 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  30 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  31.16 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  30.4 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  31.88 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  31.88 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  31.97 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  30.65 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  31.16 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  31.16 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  27.69 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  30.4 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  30.33 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0049  ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0946  50S ribosomal protein L13  31.78 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000305629  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  33.33 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  30 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1385  50S ribosomal protein L13  29.93 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  30.3 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1235  50S ribosomal protein L13  31.16 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4344  50S ribosomal protein L13  33.33 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  32.85 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  32.54 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  32.54 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  32.54 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  28.46 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  30.77 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  29.23 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  29.92 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  31.58 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1421  50S ribosomal protein L13  29.71 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.356798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  32.82 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  30.95 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0490  50S ribosomal protein L13  32.33 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000324279  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  30.08 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  29.13 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4592  50S ribosomal protein L13  29.85 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0663  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.131584  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  26.9 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  27.94 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1514  50S ribosomal protein L13  30.15 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.8697  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  30.95 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0366  50S ribosomal protein L13  31.82 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000157584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0721  50S ribosomal protein L13  31.78 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  30.83 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  30.47 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0031  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0381  50S ribosomal protein L13  31.82 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00368247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  29.77 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0500  50S ribosomal protein L13  32.31 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>