More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4592 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4592  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 154 aa  317  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2707  50S ribosomal protein L13  81.17 
 
 		 154 aa  269  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613136  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2455  50S ribosomal protein L13  80.52 
 
 		 154 aa  267  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3106  50S ribosomal protein L13  80.52 
 
 		 154 aa  265  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2696  50S ribosomal protein L13  81.17 
 
 		 154 aa  265  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0952933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1421  50S ribosomal protein L13  79.87 
 
 		 154 aa  265  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.356798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2671  50S ribosomal protein L13  80.52 
 
 		 154 aa  264  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.133439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4344  50S ribosomal protein L13  76.32 
 
 		 153 aa  253  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  77.12 
 
 		 153 aa  248  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  73.2 
 
 		 156 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1235  50S ribosomal protein L13  72.08 
 
 		 154 aa  239  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  70.78 
 
 		 154 aa  238  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  72.55 
 
 		 153 aa  237  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  71.9 
 
 		 153 aa  235  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  71.43 
 
 		 154 aa  234  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  71.43 
 
 		 154 aa  232  1.0000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  72.08 
 
 		 154 aa  232  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1178  50S ribosomal protein L13  70.59 
 
 		 153 aa  229  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1378  ribosomal protein L13  70.2 
 
 		 156 aa  229  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  74.67 
 
 		 154 aa  229  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  74.67 
 
 		 154 aa  229  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2619  50S ribosomal protein L13  69.93 
 
 		 153 aa  226  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2842  50S ribosomal protein L13  69.93 
 
 		 153 aa  226  9e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2649  50S ribosomal protein L13  69.28 
 
 		 153 aa  224  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  69.48 
 
 		 187 aa  224  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  72 
 
 		 154 aa  223  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  66.45 
 
 		 159 aa  221  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2969  50S ribosomal protein L13  64.29 
 
 		 154 aa  213  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0186742  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1514  50S ribosomal protein L13  66.23 
 
 		 154 aa  209  9e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.8697  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  63.58 
 
 		 159 aa  209  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1602  50S ribosomal protein L13  60.78 
 
 		 152 aa  203  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.206566  normal  0.915061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2426  50S ribosomal protein L13  59.74 
 
 		 164 aa  202  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0464276  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3286  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 159 aa  201  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  62.34 
 
 		 154 aa  200  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  62.34 
 
 		 154 aa  199  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  62.34 
 
 		 154 aa  199  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2250  50S ribosomal protein L13  61.74 
 
 		 158 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1385  50S ribosomal protein L13  58.82 
 
 		 152 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0067  50S ribosomal protein L13  59.87 
 
 		 152 aa  193  6e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3026  50S ribosomal protein L13  59.48 
 
 		 157 aa  191  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1477  50S ribosomal protein L13  59.06 
 
 		 160 aa  188  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.207503 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2152  50S ribosomal protein L13  55.84 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0607483  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0822  50S ribosomal protein L13  51.32 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.865147  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1019  50S ribosomal protein L13  51.97 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0840  50S ribosomal protein L13  51.97 
 
 		 152 aa  170  7.999999999999999e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.637892  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 144 aa  167  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  54.79 
 
 		 150 aa  163  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 142 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5914  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 142 aa  160  8.000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0500  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 147 aa  160  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0461  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797457  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  58.09 
 
 		 148 aa  157  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  50.68 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2044  ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000510712  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  157  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 149 aa  156  8e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 149 aa  156  8e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 142 aa  156  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4113  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  53.24 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4053  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0625  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>