More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3026 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3026  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 157 aa  328  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1514  50S ribosomal protein L13  66.45 
 
 		 154 aa  223  8e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.8697  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2649  50S ribosomal protein L13  64.47 
 
 		 153 aa  215  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2619  50S ribosomal protein L13  63.16 
 
 		 153 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2842  50S ribosomal protein L13  63.16 
 
 		 153 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  62.75 
 
 		 187 aa  210  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1421  50S ribosomal protein L13  64.05 
 
 		 154 aa  209  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.356798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  63.16 
 
 		 153 aa  208  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 153 aa  206  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1178  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 153 aa  205  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2455  50S ribosomal protein L13  61.44 
 
 		 154 aa  205  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409282  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  62.09 
 
 		 159 aa  204  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  61.04 
 
 		 154 aa  202  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1235  50S ribosomal protein L13  61.69 
 
 		 154 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3106  50S ribosomal protein L13  59.48 
 
 		 154 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2671  50S ribosomal protein L13  60.13 
 
 		 154 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.133439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2707  50S ribosomal protein L13  58.82 
 
 		 154 aa  197  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613136  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  59.74 
 
 		 154 aa  196  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  61.74 
 
 		 154 aa  194  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  58.82 
 
 		 159 aa  194  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  59.87 
 
 		 153 aa  194  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  56.69 
 
 		 156 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2969  50S ribosomal protein L13  58.17 
 
 		 154 aa  191  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0186742  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  59.09 
 
 		 154 aa  191  3e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 154 aa  191  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 154 aa  191  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4344  50S ribosomal protein L13  59.21 
 
 		 153 aa  191  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4592  50S ribosomal protein L13  59.48 
 
 		 154 aa  191  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  59.73 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1602  50S ribosomal protein L13  56.58 
 
 		 152 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.206566  normal  0.915061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1378  ribosomal protein L13  55.77 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2696  50S ribosomal protein L13  56.86 
 
 		 154 aa  187  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0952933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3286  50S ribosomal protein L13  58.17 
 
 		 159 aa  187  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0067  50S ribosomal protein L13  56.38 
 
 		 152 aa  186  9e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2250  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0840  50S ribosomal protein L13  56.58 
 
 		 152 aa  186  2e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.637892  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2426  50S ribosomal protein L13  56.21 
 
 		 164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0464276  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1385  50S ribosomal protein L13  55.26 
 
 		 152 aa  181  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0822  50S ribosomal protein L13  53.59 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.865147  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  56.21 
 
 		 154 aa  176  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  56.21 
 
 		 154 aa  176  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1019  50S ribosomal protein L13  52.94 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  54.25 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1477  50S ribosomal protein L13  52.32 
 
 		 160 aa  172  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.207503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  57.53 
 
 		 149 aa  166  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2152  50S ribosomal protein L13  52.94 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0607483  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  57.53 
 
 		 149 aa  166  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5914  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  165  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 147 aa  163  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0500  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 147 aa  163  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4053  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_008786  Veis_2638  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107212  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  53.96 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0604  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0625  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4113  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  160  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  58.99 
 
 		 148 aa  160  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4678  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.44664  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0490  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000324279  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  54.11 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0721  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  54.35 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  157  6e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0649  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  157  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.71181e-17  normal  0.0947726 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  156  8e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  157  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  54.11 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 145 aa  155  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 142 aa  155  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1886  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000953173  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1590  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000486571  normal  0.621291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  55.07 
 
 		 142 aa  154  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 147 aa  154  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  52.05 
 
 		 145 aa  153  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0366  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 142 aa  153  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000157584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0381  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 142 aa  153  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00368247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  55.47 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3452  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  153  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0225792 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  53.62 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  50 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  48.61 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  53.62 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1669  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000843127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  52.74 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  50 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  53.62 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0049  ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>