More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2426 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2426  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 164 aa  340  4e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0464276  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1602  50S ribosomal protein L13  86.84 
 
 		 152 aa  281  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.206566  normal  0.915061 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1385  50S ribosomal protein L13  83.55 
 
 		 152 aa  270  9e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2969  50S ribosomal protein L13  76.62 
 
 		 154 aa  251  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0186742  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  75.97 
 
 		 154 aa  244  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  75.97 
 
 		 154 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  75.97 
 
 		 154 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1235  50S ribosomal protein L13  68.83 
 
 		 154 aa  225  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  68.18 
 
 		 154 aa  225  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  68.18 
 
 		 154 aa  223  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  67.76 
 
 		 153 aa  221  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  69.54 
 
 		 156 aa  221  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  66.23 
 
 		 154 aa  221  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  67.76 
 
 		 154 aa  216  8.999999999999998e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  66.89 
 
 		 153 aa  216  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  67.31 
 
 		 154 aa  215  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  67.31 
 
 		 154 aa  215  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  66.23 
 
 		 153 aa  215  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1421  50S ribosomal protein L13  65.58 
 
 		 154 aa  214  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.356798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1378  ribosomal protein L13  65.79 
 
 		 156 aa  214  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2619  50S ribosomal protein L13  66.89 
 
 		 153 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2842  50S ribosomal protein L13  66.89 
 
 		 153 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1178  50S ribosomal protein L13  66.23 
 
 		 153 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2707  50S ribosomal protein L13  64.94 
 
 		 154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613136  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2455  50S ribosomal protein L13  65.36 
 
 		 154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409282  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  66.03 
 
 		 154 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2649  50S ribosomal protein L13  66.23 
 
 		 153 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2671  50S ribosomal protein L13  64.29 
 
 		 154 aa  210  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.133439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3106  50S ribosomal protein L13  62.99 
 
 		 154 aa  207  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  67.57 
 
 		 159 aa  207  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4344  50S ribosomal protein L13  60.78 
 
 		 153 aa  204  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1514  50S ribosomal protein L13  62.75 
 
 		 154 aa  205  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.8697  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4592  50S ribosomal protein L13  59.74 
 
 		 154 aa  202  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 187 aa  201  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2696  50S ribosomal protein L13  61.04 
 
 		 154 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0952933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2152  50S ribosomal protein L13  60.39 
 
 		 154 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0607483  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  62.16 
 
 		 159 aa  195  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3286  50S ribosomal protein L13  64.19 
 
 		 159 aa  195  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1477  50S ribosomal protein L13  62.42 
 
 		 160 aa  193  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.207503 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2250  50S ribosomal protein L13  61.74 
 
 		 158 aa  193  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3026  50S ribosomal protein L13  56.21 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_002978  WD0067  50S ribosomal protein L13  56.58 
 
 		 152 aa  181  3e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0822  50S ribosomal protein L13  53.95 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.865147  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1019  50S ribosomal protein L13  53.29 
 
 		 156 aa  173  8e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0840  50S ribosomal protein L13  55.26 
 
 		 152 aa  171  5e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.637892  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 144 aa  171  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  165  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 142 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 154 aa  161  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  54.55 
 
 		 147 aa  161  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  52.74 
 
 		 147 aa  160  8.000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 144 aa  158  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  50.68 
 
 		 147 aa  158  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  53.1 
 
 		 144 aa  158  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  52.05 
 
 		 147 aa  158  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0252  ribosomal protein L13  49.32 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0490  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000324279  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  55.07 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  54.35 
 
 		 144 aa  157  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  58.39 
 
 		 150 aa  157  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  52.74 
 
 		 147 aa  157  8e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  51.01 
 
 		 149 aa  157  9e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 144 aa  156  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1669  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000843127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  50.34 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2564  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  53.1 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  56.2 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  51.37 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  56.2 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2704  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191056  normal  0.974545 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000156516  hitchhiker  0.0000450928 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 142 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378048  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 144 aa  155  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1233  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 142 aa  155  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018745  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3414  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 142 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000814026  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0230  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 147 aa  155  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00330553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>