More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0067 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0067  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
152 aa  317  5e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1019  50S ribosomal protein L13  71.71 
 
 
156 aa  238  2e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0822  50S ribosomal protein L13  70.39 
 
 
156 aa  235  2e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.865147  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0840  50S ribosomal protein L13  66.45 
 
 
152 aa  233  5.0000000000000005e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.637892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  64 
 
 
187 aa  219  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  62.42 
 
 
159 aa  215  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  64 
 
 
153 aa  208  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  64 
 
 
153 aa  209  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  63.16 
 
 
153 aa  208  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1514  50S ribosomal protein L13  62.09 
 
 
154 aa  207  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.8697  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1421  50S ribosomal protein L13  61.18 
 
 
154 aa  203  6e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.356798  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2455  50S ribosomal protein L13  60.53 
 
 
154 aa  203  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409282  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 
159 aa  200  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2671  50S ribosomal protein L13  59.21 
 
 
154 aa  200  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.133439 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3286  50S ribosomal protein L13  58.39 
 
 
159 aa  200  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1178  50S ribosomal protein L13  62 
 
 
153 aa  199  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130484  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2707  50S ribosomal protein L13  58.55 
 
 
154 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613136  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  59.33 
 
 
154 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3106  50S ribosomal protein L13  57.89 
 
 
154 aa  197  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  60.67 
 
 
154 aa  197  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2842  50S ribosomal protein L13  60.67 
 
 
153 aa  197  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2649  50S ribosomal protein L13  61.33 
 
 
153 aa  197  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2619  50S ribosomal protein L13  60.67 
 
 
153 aa  197  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  59.87 
 
 
154 aa  196  7.999999999999999e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  60.93 
 
 
156 aa  195  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1235  50S ribosomal protein L13  58.67 
 
 
154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751554  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  60.26 
 
 
154 aa  194  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  60.26 
 
 
154 aa  194  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  59.21 
 
 
154 aa  193  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4592  50S ribosomal protein L13  59.87 
 
 
154 aa  193  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2696  50S ribosomal protein L13  56.58 
 
 
154 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0952933  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  58.28 
 
 
154 aa  192  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1378  ribosomal protein L13  58.94 
 
 
156 aa  190  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4344  50S ribosomal protein L13  57.33 
 
 
153 aa  190  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284229  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1602  50S ribosomal protein L13  58.55 
 
 
152 aa  189  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.206566  normal  0.915061 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2250  50S ribosomal protein L13  54.73 
 
 
158 aa  187  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3026  50S ribosomal protein L13  56.38 
 
 
157 aa  186  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1477  50S ribosomal protein L13  54.73 
 
 
160 aa  185  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.207503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2426  50S ribosomal protein L13  56.58 
 
 
164 aa  181  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0464276  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1385  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 
152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  55.26 
 
 
154 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  53.95 
 
 
154 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  53.95 
 
 
154 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2969  50S ribosomal protein L13  53.95 
 
 
154 aa  177  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0186742  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2152  50S ribosomal protein L13  51.97 
 
 
154 aa  174  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0607483  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 
144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  54.93 
 
 
150 aa  169  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 
142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 
142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 
142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  51.41 
 
 
147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  53.28 
 
 
145 aa  160  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  52.55 
 
 
145 aa  160  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  53.28 
 
 
145 aa  159  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  51.05 
 
 
142 aa  159  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 
142 aa  159  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 
142 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 
142 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 
142 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 
142 aa  158  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 
142 aa  159  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 
142 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 
142 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 
142 aa  158  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 
142 aa  158  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 
143 aa  158  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 
142 aa  157  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  51.82 
 
 
145 aa  158  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 
142 aa  157  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 
142 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 
142 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 
142 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 
142 aa  157  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0461  50S ribosomal protein L13  48.95 
 
 
142 aa  157  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797457  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  157  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 
142 aa  157  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 
142 aa  157  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 
143 aa  157  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  157  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 
142 aa  157  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  51.82 
 
 
145 aa  157  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  51.82 
 
 
145 aa  157  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  51.82 
 
 
145 aa  157  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  51.82 
 
 
145 aa  157  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  51.82 
 
 
145 aa  157  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  51.82 
 
 
145 aa  157  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  51.82 
 
 
145 aa  157  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  47.18 
 
 
163 aa  157  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 
142 aa  156  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  51.05 
 
 
142 aa  156  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 
142 aa  156  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 
142 aa  156  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 
142 aa  156  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  51.05 
 
 
142 aa  156  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 
142 aa  157  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 
142 aa  156  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 
142 aa  156  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 
142 aa  156  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 
142 aa  157  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>