More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1378 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1378  ribosomal protein L13  100 
 
 		 156 aa  319  7e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  85.71 
 
 		 156 aa  283  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  81.88 
 
 		 153 aa  254  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4344  50S ribosomal protein L13  76.97 
 
 		 153 aa  253  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  79.87 
 
 		 153 aa  251  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2842  50S ribosomal protein L13  80.54 
 
 		 153 aa  249  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2619  50S ribosomal protein L13  80.54 
 
 		 153 aa  249  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  75.5 
 
 		 154 aa  246  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1178  50S ribosomal protein L13  78.52 
 
 		 153 aa  245  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2649  50S ribosomal protein L13  79.87 
 
 		 153 aa  246  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2707  50S ribosomal protein L13  74.83 
 
 		 154 aa  243  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613136  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2671  50S ribosomal protein L13  74.83 
 
 		 154 aa  243  9e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.133439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3106  50S ribosomal protein L13  74.17 
 
 		 154 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1235  50S ribosomal protein L13  73.51 
 
 		 154 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1421  50S ribosomal protein L13  72.85 
 
 		 154 aa  241  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.356798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2455  50S ribosomal protein L13  73.51 
 
 		 154 aa  241  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409282  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  74.17 
 
 		 153 aa  239  7.999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  72.19 
 
 		 154 aa  239  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  72.19 
 
 		 154 aa  238  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2696  50S ribosomal protein L13  70.86 
 
 		 154 aa  231  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0952933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  70 
 
 		 154 aa  229  1e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4592  50S ribosomal protein L13  70.2 
 
 		 154 aa  229  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  71.62 
 
 		 154 aa  228  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  71.62 
 
 		 154 aa  228  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  70.95 
 
 		 154 aa  227  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2969  50S ribosomal protein L13  67.76 
 
 		 154 aa  226  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0186742  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  70.86 
 
 		 187 aa  223  6e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1602  50S ribosomal protein L13  68.42 
 
 		 152 aa  222  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.206566  normal  0.915061 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  69.59 
 
 		 159 aa  221  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  67.76 
 
 		 154 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  66.45 
 
 		 154 aa  215  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  66.45 
 
 		 154 aa  215  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1514  50S ribosomal protein L13  69.08 
 
 		 154 aa  215  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.8697  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2426  50S ribosomal protein L13  65.79 
 
 		 164 aa  214  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0464276  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  65.13 
 
 		 159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1385  50S ribosomal protein L13  63.82 
 
 		 152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2250  50S ribosomal protein L13  63.76 
 
 		 158 aa  203  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2152  50S ribosomal protein L13  61.84 
 
 		 154 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0607483  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1477  50S ribosomal protein L13  63.09 
 
 		 160 aa  197  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.207503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3286  50S ribosomal protein L13  62.84 
 
 		 159 aa  193  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0067  50S ribosomal protein L13  58.94 
 
 		 152 aa  190  6e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3026  50S ribosomal protein L13  55.77 
 
 		 157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0822  50S ribosomal protein L13  55.19 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.865147  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1019  50S ribosomal protein L13  55.84 
 
 		 156 aa  176  7e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0840  50S ribosomal protein L13  56.67 
 
 		 152 aa  174  3e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.637892  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 145 aa  167  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  55.07 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  53.79 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 144 aa  164  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0490  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000324279  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 144 aa  163  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  164  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  58.82 
 
 		 148 aa  163  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  52.74 
 
 		 149 aa  163  9e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 145 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0721  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>