More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0787 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
154 aa  317  5e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
154 aa  317  5e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  95.45 
 
 
154 aa  306  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  86.36 
 
 
154 aa  282  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  87.42 
 
 
154 aa  280  6.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1235  50S ribosomal protein L13  86.67 
 
 
154 aa  276  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751554  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  86 
 
 
154 aa  276  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  86 
 
 
153 aa  271  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  84 
 
 
154 aa  268  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  77.03 
 
 
156 aa  239  9e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1421  50S ribosomal protein L13  78 
 
 
154 aa  239  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.356798  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2696  50S ribosomal protein L13  77.33 
 
 
154 aa  239  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0952933  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2671  50S ribosomal protein L13  77.48 
 
 
154 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.133439 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2455  50S ribosomal protein L13  77.33 
 
 
154 aa  238  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409282  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2707  50S ribosomal protein L13  78 
 
 
154 aa  237  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613136  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3106  50S ribosomal protein L13  77.33 
 
 
154 aa  235  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  76 
 
 
153 aa  234  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  75.33 
 
 
153 aa  234  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1178  50S ribosomal protein L13  74 
 
 
153 aa  233  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130484  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2969  50S ribosomal protein L13  72.08 
 
 
154 aa  232  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0186742  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  71.71 
 
 
159 aa  231  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  71.33 
 
 
187 aa  229  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4592  50S ribosomal protein L13  74.67 
 
 
154 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1378  ribosomal protein L13  71.62 
 
 
156 aa  228  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  70.13 
 
 
154 aa  226  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2649  50S ribosomal protein L13  72.67 
 
 
153 aa  226  9e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4344  50S ribosomal protein L13  68.63 
 
 
153 aa  224  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284229  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  68.83 
 
 
154 aa  224  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  68.83 
 
 
154 aa  224  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2619  50S ribosomal protein L13  72 
 
 
153 aa  223  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2842  50S ribosomal protein L13  72 
 
 
153 aa  223  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1602  50S ribosomal protein L13  70 
 
 
152 aa  223  8e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.206566  normal  0.915061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1514  50S ribosomal protein L13  68.87 
 
 
154 aa  220  6e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.8697  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2250  50S ribosomal protein L13  68.46 
 
 
158 aa  218  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2426  50S ribosomal protein L13  67.31 
 
 
164 aa  215  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0464276  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3286  50S ribosomal protein L13  69.74 
 
 
159 aa  213  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  68.03 
 
 
159 aa  213  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1385  50S ribosomal protein L13  64.67 
 
 
152 aa  212  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1477  50S ribosomal protein L13  65.36 
 
 
160 aa  206  8e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.207503 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2152  50S ribosomal protein L13  61.69 
 
 
154 aa  205  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0607483  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0067  50S ribosomal protein L13  60.26 
 
 
152 aa  194  4.0000000000000005e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3026  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
157 aa  191  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0840  50S ribosomal protein L13  54.3 
 
 
152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.637892  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0822  50S ribosomal protein L13  56 
 
 
156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.865147  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1019  50S ribosomal protein L13  55.33 
 
 
156 aa  180  7e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  176  9e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  172  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  172  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  172  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  56.64 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 
142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 
142 aa  170  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 
142 aa  170  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 
142 aa  170  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0490  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 
142 aa  169  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000324279  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  54.55 
 
 
142 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 
148 aa  169  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0366  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 
142 aa  168  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000157584  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0381  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 
142 aa  168  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00368247  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
142 aa  168  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3452  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 
142 aa  168  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0225792 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2564  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 
161 aa  167  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007734  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 
144 aa  168  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 
142 aa  167  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 
142 aa  167  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 
142 aa  167  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 
142 aa  167  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 
142 aa  167  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 
142 aa  167  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0230  50S ribosomal protein L13  57.93 
 
 
147 aa  167  6e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00330553  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2638  50S ribosomal protein L13  54.73 
 
 
147 aa  167  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107212  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 
142 aa  166  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000156516  hitchhiker  0.0000450928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 
142 aa  166  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0500  50S ribosomal protein L13  55.56 
 
 
147 aa  166  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  56.2 
 
 
149 aa  166  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 
142 aa  166  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  56.2 
 
 
149 aa  166  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 
142 aa  166  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0625  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 
142 aa  165  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0573  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 
142 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000226518  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0679  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 
142 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000098694  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4053  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 
142 aa  165  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.536973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>