More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2176 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 154 aa  320  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  96.1 
 
 		 154 aa  313  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  96.1 
 
 		 154 aa  313  7e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2969  50S ribosomal protein L13  87.01 
 
 		 154 aa  280  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0186742  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1385  50S ribosomal protein L13  76.47 
 
 		 152 aa  253  8e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1602  50S ribosomal protein L13  77.12 
 
 		 152 aa  245  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.206566  normal  0.915061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2426  50S ribosomal protein L13  75.97 
 
 		 164 aa  244  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0464276  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  70.13 
 
 		 154 aa  234  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  68.18 
 
 		 154 aa  228  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  71.24 
 
 		 153 aa  228  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  70.13 
 
 		 154 aa  228  3e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  70.13 
 
 		 154 aa  226  9e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  70.13 
 
 		 154 aa  226  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2152  50S ribosomal protein L13  64.29 
 
 		 154 aa  226  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0607483  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  71.43 
 
 		 154 aa  225  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1235  50S ribosomal protein L13  68.18 
 
 		 154 aa  223  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  66.88 
 
 		 154 aa  223  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  70.59 
 
 		 156 aa  221  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1378  ribosomal protein L13  67.76 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  66.23 
 
 		 187 aa  214  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1421  50S ribosomal protein L13  67.53 
 
 		 154 aa  214  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.356798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2455  50S ribosomal protein L13  66.88 
 
 		 154 aa  214  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409282  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  65.13 
 
 		 159 aa  214  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1514  50S ribosomal protein L13  66.01 
 
 		 154 aa  213  8e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.8697  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2707  50S ribosomal protein L13  67.53 
 
 		 154 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613136  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2671  50S ribosomal protein L13  66.88 
 
 		 154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.133439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3106  50S ribosomal protein L13  65.58 
 
 		 154 aa  209  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  65.56 
 
 		 153 aa  208  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  65.56 
 
 		 153 aa  208  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2696  50S ribosomal protein L13  65.58 
 
 		 154 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0952933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4344  50S ribosomal protein L13  62.09 
 
 		 153 aa  204  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1178  50S ribosomal protein L13  62.75 
 
 		 153 aa  202  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2842  50S ribosomal protein L13  63.4 
 
 		 153 aa  201  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2619  50S ribosomal protein L13  63.4 
 
 		 153 aa  201  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 159 aa  201  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4592  50S ribosomal protein L13  62.34 
 
 		 154 aa  200  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2649  50S ribosomal protein L13  63.58 
 
 		 153 aa  200  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1477  50S ribosomal protein L13  63.09 
 
 		 160 aa  199  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.207503 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2250  50S ribosomal protein L13  60.4 
 
 		 158 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3286  50S ribosomal protein L13  63.82 
 
 		 159 aa  198  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0822  50S ribosomal protein L13  55.92 
 
 		 156 aa  186  7e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.865147  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1019  50S ribosomal protein L13  55.92 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0840  50S ribosomal protein L13  55.92 
 
 		 152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.637892  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0067  50S ribosomal protein L13  55.26 
 
 		 152 aa  180  8.000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0230  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00330553  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3026  50S ribosomal protein L13  54.25 
 
 		 157 aa  175  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  56.94 
 
 		 154 aa  173  6e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  53.79 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  54.79 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  171  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  54.42 
 
 		 149 aa  170  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 151 aa  168  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 145 aa  168  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  51.37 
 
 		 145 aa  167  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  52.74 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  54.11 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  50 
 
 		 145 aa  167  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  51.37 
 
 		 147 aa  167  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  54.55 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 149 aa  166  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 149 aa  166  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 148 aa  164  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  54.42 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  55 
 
 		 147 aa  164  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 147 aa  163  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 147 aa  163  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  52.74 
 
 		 147 aa  163  9e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  52.74 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  51.37 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  54.35 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  55.17 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 146 aa  161  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  50.7 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  51.37 
 
 		 150 aa  161  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 144 aa  160  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2918  50S ribosomal protein L13  52.74 
 
 		 147 aa  160  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 148 aa  160  8.000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000083935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>