More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3286 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3286  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 159 aa  323  5e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  73.58 
 
 		 159 aa  250  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  75.47 
 
 		 159 aa  249  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  70.86 
 
 		 153 aa  226  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  72 
 
 		 154 aa  224  3e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1235  50S ribosomal protein L13  72.3 
 
 		 154 aa  221  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  71.62 
 
 		 154 aa  221  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  72.92 
 
 		 154 aa  219  8e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2671  50S ribosomal protein L13  68.42 
 
 		 154 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.133439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2707  50S ribosomal protein L13  69.59 
 
 		 154 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613136  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  68.24 
 
 		 153 aa  214  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  69.74 
 
 		 154 aa  213  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  69.74 
 
 		 154 aa  213  7e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2842  50S ribosomal protein L13  68.92 
 
 		 153 aa  213  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2619  50S ribosomal protein L13  68.92 
 
 		 153 aa  213  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  68.92 
 
 		 154 aa  213  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  67.57 
 
 		 153 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2696  50S ribosomal protein L13  68.24 
 
 		 154 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0952933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1477  50S ribosomal protein L13  66.88 
 
 		 160 aa  213  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.207503 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1421  50S ribosomal protein L13  68.24 
 
 		 154 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.356798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2649  50S ribosomal protein L13  68.24 
 
 		 153 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  69.8 
 
 		 154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3106  50S ribosomal protein L13  67.57 
 
 		 154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2455  50S ribosomal protein L13  67.57 
 
 		 154 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409282  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2250  50S ribosomal protein L13  64.67 
 
 		 158 aa  210  7.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1178  50S ribosomal protein L13  66.89 
 
 		 153 aa  209  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  67.57 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  64.19 
 
 		 187 aa  206  9e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4344  50S ribosomal protein L13  66.89 
 
 		 153 aa  202  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4592  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 154 aa  201  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0067  50S ribosomal protein L13  58.39 
 
 		 152 aa  200  7e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  63.82 
 
 		 154 aa  198  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  63.16 
 
 		 154 aa  197  7e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  63.16 
 
 		 154 aa  197  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2426  50S ribosomal protein L13  64.19 
 
 		 164 aa  195  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0464276  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2969  50S ribosomal protein L13  63.82 
 
 		 154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0186742  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1602  50S ribosomal protein L13  62.84 
 
 		 152 aa  194  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.206566  normal  0.915061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1378  ribosomal protein L13  62.84 
 
 		 156 aa  193  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2152  50S ribosomal protein L13  60.53 
 
 		 154 aa  193  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0607483  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3026  50S ribosomal protein L13  58.17 
 
 		 157 aa  187  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1514  50S ribosomal protein L13  58.55 
 
 		 154 aa  185  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.8697  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0822  50S ribosomal protein L13  52.7 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.865147  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1019  50S ribosomal protein L13  52.7 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1385  50S ribosomal protein L13  57.43 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  54.01 
 
 		 144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 144 aa  168  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0840  50S ribosomal protein L13  48.99 
 
 		 152 aa  166  8e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.637892  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  167  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  56.93 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 148 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  56.2 
 
 		 142 aa  163  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0461  50S ribosomal protein L13  54.01 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 148 aa  161  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  54.01 
 
 		 142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  53.47 
 
 		 147 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  53.47 
 
 		 147 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  54.01 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000156516  hitchhiker  0.0000450928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>