More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_1019 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_1019  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 156 aa  327  4e-89  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0822  50S ribosomal protein L13  95.51 
 
 		 156 aa  316  6e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.865147  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0067  50S ribosomal protein L13  71.71 
 
 		 152 aa  238  2e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0840  50S ribosomal protein L13  65.13 
 
 		 152 aa  224  4e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.637892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  57.24 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  58.67 
 
 		 153 aa  189  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  58.67 
 
 		 153 aa  189  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1514  50S ribosomal protein L13  56.21 
 
 		 154 aa  188  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.8697  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  53.38 
 
 		 159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  56.67 
 
 		 153 aa  186  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  55.92 
 
 		 154 aa  185  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2250  50S ribosomal protein L13  52.98 
 
 		 158 aa  184  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  55.33 
 
 		 154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4344  50S ribosomal protein L13  55.33 
 
 		 153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  55.33 
 
 		 154 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  56.49 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1178  50S ribosomal protein L13  57.33 
 
 		 153 aa  180  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130484  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  55.33 
 
 		 154 aa  180  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  55.33 
 
 		 154 aa  180  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3286  50S ribosomal protein L13  52.7 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2619  50S ribosomal protein L13  57.33 
 
 		 153 aa  179  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  53.95 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2842  50S ribosomal protein L13  57.33 
 
 		 153 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1235  50S ribosomal protein L13  54.67 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2649  50S ribosomal protein L13  57.33 
 
 		 153 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  54 
 
 		 154 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1602  50S ribosomal protein L13  53.95 
 
 		 152 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.206566  normal  0.915061 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2152  50S ribosomal protein L13  52.63 
 
 		 154 aa  177  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0607483  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2671  50S ribosomal protein L13  55.26 
 
 		 154 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.133439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2707  50S ribosomal protein L13  55.33 
 
 		 154 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613136  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2696  50S ribosomal protein L13  54 
 
 		 154 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0952933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2455  50S ribosomal protein L13  56.67 
 
 		 154 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3106  50S ribosomal protein L13  55.33 
 
 		 154 aa  177  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2969  50S ribosomal protein L13  53.95 
 
 		 154 aa  177  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0186742  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1378  ribosomal protein L13  55.84 
 
 		 156 aa  176  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1477  50S ribosomal protein L13  51.01 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.207503 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1421  50S ribosomal protein L13  55.33 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.356798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3026  50S ribosomal protein L13  52.94 
 
 		 157 aa  175  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 159 aa  174  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2426  50S ribosomal protein L13  53.29 
 
 		 164 aa  173  7e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0464276  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  53.29 
 
 		 154 aa  173  7e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1385  50S ribosomal protein L13  51.97 
 
 		 152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4592  50S ribosomal protein L13  51.97 
 
 		 154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  55.48 
 
 		 147 aa  167  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  52.41 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  53.1 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  51.03 
 
 		 150 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  56.2 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  51.7 
 
 		 149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  53.62 
 
 		 143 aa  160  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  50.71 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0375  50S ribosomal protein L13  48.65 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.958432 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  53.42 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 144 aa  159  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  53.15 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  47.89 
 
 		 163 aa  157  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  52.21 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  52.21 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  52.21 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  48.94 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  52.21 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  52.21 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  52.21 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  52.21 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  52.94 
 
 		 145 aa  157  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  52.21 
 
 		 145 aa  156  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  50 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  52.74 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  51.47 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  52.94 
 
 		 145 aa  155  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 142 aa  154  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 142 aa  154  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  48.95 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  48.95 
 
 		 142 aa  153  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  52.21 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  153  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  48.95 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  52.17 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  51.37 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>