274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1242 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  100 
 
 		 140 aa  277  4e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  66.43 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  62.86 
 
 		 140 aa  183  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  59.29 
 
 		 140 aa  168  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  56.43 
 
 		 140 aa  166  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  54.29 
 
 		 140 aa  156  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  48.2 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  44.6 
 
 		 138 aa  129  9e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  42.65 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  47.45 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  45.99 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  43.07 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  44.53 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  45.52 
 
 		 138 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  41.91 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  44.29 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  43.18 
 
 		 137 aa  103  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  42.42 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  42.42 
 
 		 137 aa  100  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  41.67 
 
 		 137 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  38.81 
 
 		 179 aa  95.1  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  37.06 
 
 		 199 aa  94.4  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  36.23 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  39.58 
 
 		 200 aa  90.1  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  35.25 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  37.93 
 
 		 202 aa  85.1  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  37.86 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  36.36 
 
 		 199 aa  84.7  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  32.17 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  39.45 
 
 		 186 aa  80.1  0.000000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  35.66 
 
 		 201 aa  77  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  32.17 
 
 		 182 aa  77  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  30.82 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04085  50S ribosomal protein L13  32.31 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  31.78 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0031  50S ribosomal protein L13  26.19 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  30.16 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15678  Plastid ribosomal protein L13 large ribosomal subunit  30 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0368905  hitchhiker  0.00903198 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  32.14 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  31.54 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  28.23 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  29.23 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0561  50S ribosomal protein L13  31.78 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224516  normal  0.196899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  29.46 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  29.46 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  29.23 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  29.51 
 
 		 151 aa  50.8  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  26.98 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  28.81 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  30.77 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  33.62 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  30.36 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  29.57 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0869  ribosomal protein L13  32.46 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0055  50S ribosomal protein L13  29.31 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00159664  normal  0.826314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  32.31 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0677  50S ribosomal protein L13  28.72 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  29.46 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  24 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  32.31 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  48.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  33.04 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0049  ribosomal protein L13  26.36 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  48.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  48.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  27.69 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  27.66 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  25.89 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  27.69 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  27.69 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0322  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000362186  hitchhiker  1.16201e-17 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  27.13 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  26.98 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>