285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2594 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  100 
 
 		 148 aa  303  7e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  75.84 
 
 		 149 aa  234  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  76.35 
 
 		 151 aa  234  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  74.5 
 
 		 149 aa  230  5e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  74.32 
 
 		 146 aa  226  6e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  46.32 
 
 		 140 aa  137  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  50.36 
 
 		 140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  46.32 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  47.1 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  47.45 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  44.44 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  42.65 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  44.12 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  40.15 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  43.26 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  43.85 
 
 		 137 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  43.85 
 
 		 137 aa  106  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  42.75 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  35.92 
 
 		 179 aa  104  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  45.8 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  40 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  38.78 
 
 		 185 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  35.81 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  31.29 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  36.55 
 
 		 182 aa  86.7  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  36.73 
 
 		 186 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  35.71 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  30.41 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  33.79 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.33 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  30.2 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  31.21 
 
 		 201 aa  72  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  31.13 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  34.51 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  33.04 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0031  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  33.04 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  28.46 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  30.09 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  31.75 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  30.65 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  30.09 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  26.98 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  28.32 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  26.98 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  30.65 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  29.63 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  26.98 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  30 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  28.46 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  28.46 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  26.98 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  26.12 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1378  ribosomal protein L13  30.08 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  26.12 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  26.98 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  30.89 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  29.84 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  25.37 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  26.19 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  26.19 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  26.19 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  29.46 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  26.19 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  26.19 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  27.34 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  26.19 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  26.19 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  29.41 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  26.19 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  27.34 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  26.43 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  26.19 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  26.19 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  26.19 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  26.19 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  26.19 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  27.78 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  29.69 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  25.4 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  30.97 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  26.98 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  26.19 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  26.19 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  26.98 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  26.92 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  29.31 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  28.46 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  30.09 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  29.31 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>