37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_25375 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  53.3 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  49.25 
 
 		 202 aa  196  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  45.73 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  50.84 
 
 		 199 aa  194  7e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  39.72 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  31.21 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  32.17 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  35.42 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  33.57 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  35.66 
 
 		 140 aa  77  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  35.42 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  32.41 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  36.97 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  32.37 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  42.31 
 
 		 140 aa  73.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  31.21 
 
 		 148 aa  72  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  30.5 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  39.25 
 
 		 140 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  31.69 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  37.25 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  33.56 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  36.11 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  34.93 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  30.22 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  29.14 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  36.17 
 
 		 137 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  36.17 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  31.72 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  29.56 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  35.11 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  28.49 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  36.17 
 
 		 137 aa  57  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  27.69 
 
 		 148 aa  45.1  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  25 
 
 		 142 aa  42.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  25 
 
 		 142 aa  42.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  24.82 
 
 		 149 aa  42  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>