288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1096 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  100 
 
 		 138 aa  279  9e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  76.98 
 
 		 137 aa  201  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  76.19 
 
 		 137 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  76.19 
 
 		 137 aa  196  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  71.43 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  45.14 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  47.92 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  45.14 
 
 		 140 aa  124  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  45.39 
 
 		 139 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  43.26 
 
 		 149 aa  119  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  43.97 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  44.93 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  45.52 
 
 		 140 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  42.96 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  41.96 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  40.97 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  43.38 
 
 		 179 aa  114  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  43.26 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  46.04 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  42.55 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  40.43 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  41.3 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  37.86 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  35.97 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  33.33 
 
 		 186 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  34.03 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  32.64 
 
 		 182 aa  80.5  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  32.65 
 
 		 186 aa  80.5  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  38.1 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  32.64 
 
 		 199 aa  77  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  35.17 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  30.07 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  31.69 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  32.48 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  38.79 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  34.69 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  33.59 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  37.39 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  35.9 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  39.83 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  32.48 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  30.77 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  31.9 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1234  ribosomal protein L13  31.9 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00635155  normal  0.252185 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  31.93 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0663  50S ribosomal protein L13  35.54 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.131584  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0375  50S ribosomal protein L13  30 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.958432 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  31.62 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  35.4 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  31.62 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  32.5 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  31.09 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1941  ribosomal protein L13  31.9 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  28.7 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1612  50S ribosomal protein L13  31.97 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0318086  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  30 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  30.83 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  30.17 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  29.06 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  36.29 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  32.81 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  32.23 
 
 		 142 aa  50.1  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  31.67 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  31.67 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5914  50S ribosomal protein L13  32.48 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  32.23 
 
 		 142 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  32.23 
 
 		 142 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  31.67 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  32.23 
 
 		 142 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  33.59 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  31.93 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  35.54 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  31.67 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  34.17 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  30.25 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  34.19 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  30.25 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  30.25 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  30.83 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  30.77 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  30.83 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  29.17 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  34.19 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  31.4 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  29.17 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  32.5 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04085  50S ribosomal protein L13  27.56 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  28.45 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  29.51 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  32.48 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  30.83 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  28.45 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15678  Plastid ribosomal protein L13 large ribosomal subunit  33.08 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0368905  hitchhiker  0.00903198 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  32.77 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1669  50S ribosomal protein L13  30.51 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000843127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  35.29 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3452  50S ribosomal protein L13  35.77 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0225792 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  32.5 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0625  50S ribosomal protein L13  31.62 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>