More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0695 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  100 
 
 		 185 aa  367  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  78.74 
 
 		 182 aa  290  6e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  74.73 
 
 		 186 aa  290  1e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  73.66 
 
 		 186 aa  287  5.0000000000000004e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  51.79 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  38.46 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  42.96 
 
 		 136 aa  98.2  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  39.16 
 
 		 139 aa  94.7  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  38.78 
 
 		 148 aa  93.2  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  39.1 
 
 		 202 aa  92  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  40.29 
 
 		 138 aa  90.9  8e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  35.14 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  44.55 
 
 		 140 aa  90.5  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  38.03 
 
 		 147 aa  89.7  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  38.73 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  38.73 
 
 		 149 aa  87.8  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  44.33 
 
 		 137 aa  87.4  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  37.41 
 
 		 140 aa  86.3  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  35.62 
 
 		 149 aa  85.9  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  38.57 
 
 		 140 aa  85.1  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  33.57 
 
 		 140 aa  85.1  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  39.22 
 
 		 146 aa  84  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  34.03 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  35.86 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  35.15 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  42.27 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  44 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  32.17 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  36.55 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  44 
 
 		 137 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  37.59 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  35.09 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  35.09 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  29.14 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1653  50S ribosomal protein L13  35.4 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1473  50S ribosomal protein L13  35.4 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00205276  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0911  50S ribosomal protein L13  35.4 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1827  50S ribosomal protein L13  34.51 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000510048  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0384  50S ribosomal protein L13  35.4 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.618287  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0737  50S ribosomal protein L13  35.4 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.664104  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  34.96 
 
 		 149 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  35.71 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  34.96 
 
 		 149 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4027  ribosomal protein L13  33.59 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.240454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  34.17 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  31.86 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  33.63 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  33.04 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  33.04 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  33.33 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  33.04 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  33.04 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  36.61 
 
 		 145 aa  53.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  35.59 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  37.21 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  33.04 
 
 		 143 aa  52.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  29.31 
 
 		 148 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  29.06 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  29.57 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  32.14 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  33.33 
 
 		 154 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0387  50S ribosomal protein L13  32.74 
 
 		 141 aa  52.4  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  33.93 
 
 		 142 aa  52.4  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  29.85 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  32.77 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  36.13 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  31.58 
 
 		 142 aa  51.6  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  34.21 
 
 		 142 aa  51.6  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  30.25 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  31.4 
 
 		 142 aa  51.6  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 149 aa  51.2  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2044  ribosomal protein L13  35.09 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000510712  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  31.4 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  31.4 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  31.4 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  31.4 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  30.71 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  31.4 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  31.4 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  31.86 
 
 		 144 aa  51.2  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  31.4 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  31.4 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  31.4 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  34.17 
 
 		 144 aa  51.2  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  31.4 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  31.4 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  31.4 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  31.4 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  33.9 
 
 		 154 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  31.03 
 
 		 151 aa  51.2  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  31.62 
 
 		 144 aa  51.2  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  33.04 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  29.41 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  30.43 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  30.6 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  29.41 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  33.05 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>