186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0269 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  100 
 
 		 137 aa  272  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  97.62 
 
 		 137 aa  247  4e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  96.03 
 
 		 137 aa  246  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  84.13 
 
 		 137 aa  224  4e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  77.21 
 
 		 138 aa  217  6e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  46.31 
 
 		 140 aa  130  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  45.95 
 
 		 140 aa  124  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  44.06 
 
 		 139 aa  123  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  46.62 
 
 		 140 aa  121  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  45.21 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  41.89 
 
 		 140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  44.76 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  44.22 
 
 		 140 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  45.39 
 
 		 138 aa  115  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  42.86 
 
 		 136 aa  115  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  45.07 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  50.89 
 
 		 179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  42.86 
 
 		 148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  41.26 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  42.55 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  46.36 
 
 		 186 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  40.14 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  37.41 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  38.13 
 
 		 154 aa  90.9  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  41.13 
 
 		 149 aa  90.5  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  40.91 
 
 		 185 aa  88.2  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  41.96 
 
 		 182 aa  87.8  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  41.82 
 
 		 186 aa  84.7  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  39.42 
 
 		 199 aa  77.4  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  32.19 
 
 		 202 aa  70.9  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  30.83 
 
 		 199 aa  70.5  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  32.65 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  33.98 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  36.13 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  36.21 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  33.33 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  29.41 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  34.48 
 
 		 144 aa  50.1  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  32.85 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  31.3 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  31.3 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  31.62 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  29.32 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  31.62 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  31.3 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  32.12 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  33.86 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  31.75 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  29.66 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  35.54 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  32.5 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  34.45 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1941  ribosomal protein L13  30.77 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  31.3 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  31.03 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  31.15 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  32.23 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1234  ribosomal protein L13  27.83 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00635155  normal  0.252185 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  28.45 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  27.56 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0055  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00159664  normal  0.826314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  30.08 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  34.71 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  32.48 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0946  50S ribosomal protein L13  32.2 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000305629  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  30.08 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_002950  PG0375  50S ribosomal protein L13  29.29 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.958432 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  30.58 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  27.83 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0663  50S ribosomal protein L13  32.77 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.131584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  31.9 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  30.51 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  30.58 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  29.84 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  31.9 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  29.29 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1514  50S ribosomal protein L13  28.81 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.8697  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  30.33 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  31.62 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0052  50S ribosomal protein L13  28.8 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  31.36 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  31.5 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  27.34 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  29.41 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  30.17 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  29.51 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  29.51 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  25.4 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  29.66 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  29.57 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  35.29 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  32 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  30.17 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  31.36 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04085  50S ribosomal protein L13  31.09 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  31.03 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1941  50S ribosomal protein L13  32.23 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.62792e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  31.67 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  29.57 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0252  50S ribosomal protein L13  32.23 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000674786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>