More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0737 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0737  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
142 aa  292  9e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.664104  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0911  50S ribosomal protein L13  97.89 
 
 
142 aa  289  1e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1473  50S ribosomal protein L13  88.03 
 
 
147 aa  259  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00205276  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1653  50S ribosomal protein L13  88.03 
 
 
141 aa  258  2e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1827  50S ribosomal protein L13  87.32 
 
 
147 aa  258  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000510048  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0387  50S ribosomal protein L13  88.03 
 
 
141 aa  257  5.0000000000000005e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0384  50S ribosomal protein L13  87.05 
 
 
142 aa  255  1e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.618287  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1597  50S ribosomal protein L13  76.76 
 
 
141 aa  226  7e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219033  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1909  ribosomal protein L13  76.3 
 
 
142 aa  219  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0092  50S ribosomal protein L13  63.77 
 
 
140 aa  200  5e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  61.94 
 
 
145 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  61.19 
 
 
145 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  59.7 
 
 
142 aa  169  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0461  50S ribosomal protein L13  55.07 
 
 
142 aa  168  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  60.31 
 
 
142 aa  168  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  58.21 
 
 
142 aa  167  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  60.45 
 
 
142 aa  167  6e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  60.15 
 
 
142 aa  167  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  58.21 
 
 
142 aa  166  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  58.21 
 
 
142 aa  166  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  58.21 
 
 
142 aa  166  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  57.66 
 
 
143 aa  166  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  58.09 
 
 
142 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  58.21 
 
 
142 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  58.21 
 
 
142 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 
142 aa  166  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  57.66 
 
 
143 aa  165  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  58.21 
 
 
142 aa  165  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  58.7 
 
 
142 aa  165  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  58.7 
 
 
142 aa  165  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  58.96 
 
 
142 aa  165  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  57.46 
 
 
142 aa  164  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  58.21 
 
 
143 aa  164  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  57.46 
 
 
142 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  57.46 
 
 
142 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  58.21 
 
 
142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 
142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  58.21 
 
 
142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  58.21 
 
 
142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  57.46 
 
 
142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 
142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 
142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 
142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  57.46 
 
 
145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2044  ribosomal protein L13  58.21 
 
 
142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000510712  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  58.46 
 
 
142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  57.46 
 
 
145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  54.01 
 
 
143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 
142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  52.63 
 
 
143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 
142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  52.55 
 
 
146 aa  161  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  57.89 
 
 
142 aa  161  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
145 aa  161  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
145 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
145 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
145 aa  161  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
145 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
145 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
145 aa  161  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  55.15 
 
 
142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 
163 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  58.52 
 
 
142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  57.46 
 
 
145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
142 aa  160  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  56.72 
 
 
142 aa  160  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
142 aa  160  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
142 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  59.7 
 
 
144 aa  160  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
142 aa  160  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
142 aa  160  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
142 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
142 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
142 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
142 aa  160  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
142 aa  160  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
142 aa  160  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  56.72 
 
 
142 aa  160  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
142 aa  160  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 
142 aa  160  6e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
142 aa  160  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 
142 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 
142 aa  160  6e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  58.96 
 
 
142 aa  160  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  59.7 
 
 
144 aa  160  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  58.46 
 
 
142 aa  160  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  51.09 
 
 
146 aa  159  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  55.97 
 
 
149 aa  159  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  55.15 
 
 
142 aa  159  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  59.69 
 
 
142 aa  159  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 
144 aa  159  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  56.2 
 
 
151 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  58.96 
 
 
142 aa  159  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 
142 aa  158  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 
142 aa  158  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  59.69 
 
 
143 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 
142 aa  158  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>