288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM02320 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  100 
 
 		 199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  67.18 
 
 		 202 aa  268  5e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  59.61 
 
 		 200 aa  241  7e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  50.6 
 
 		 201 aa  184  8e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  47.9 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  40 
 
 		 179 aa  98.2  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  41.26 
 
 		 140 aa  90.1  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  50.96 
 
 		 140 aa  89.4  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  37.06 
 
 		 139 aa  87.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  40.98 
 
 		 154 aa  87.8  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  34.46 
 
 		 154 aa  85.9  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  40 
 
 		 136 aa  85.1  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  36.36 
 
 		 140 aa  84.7  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  35.42 
 
 		 140 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  35.86 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  36 
 
 		 149 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  41.75 
 
 		 138 aa  80.5  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  36.54 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  35.14 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  33.57 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  44.66 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  32.35 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  32.64 
 
 		 138 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  37.41 
 
 		 147 aa  77.4  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  35.17 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  42.55 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  29.8 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  42.55 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  42.55 
 
 		 137 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  31.13 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  41.49 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  29.14 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  30.07 
 
 		 146 aa  67  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  34.4 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  32.2 
 
 		 145 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  34.85 
 
 		 142 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  30.83 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  32.84 
 
 		 142 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  30.51 
 
 		 147 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  31.01 
 
 		 144 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  31.5 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  30.08 
 
 		 142 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  29.01 
 
 		 142 aa  52.4  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  31.3 
 
 		 144 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  32.06 
 
 		 144 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  31.34 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0604  50S ribosomal protein L13  31.34 
 
 		 142 aa  52  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0625  50S ribosomal protein L13  31.34 
 
 		 142 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  30.3 
 
 		 144 aa  52  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4053  50S ribosomal protein L13  31.34 
 
 		 142 aa  51.6  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  28.03 
 
 		 142 aa  51.2  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  31.93 
 
 		 143 aa  51.2  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  28.03 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  28.03 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  28.03 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  28.03 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  28.03 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  27.91 
 
 		 154 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  28.03 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  28.03 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5914  50S ribosomal protein L13  31.34 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  28.03 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  28.03 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  27.07 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  26.12 
 
 		 142 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  27.07 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  28.03 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  26.12 
 
 		 142 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  28.03 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  28.03 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  28.03 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0946  50S ribosomal protein L13  31.3 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000305629  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  29.63 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  28.03 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  30.25 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  30.47 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  29.63 
 
 		 142 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  28.89 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_010524  Lcho_3452  50S ribosomal protein L13  32.09 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0225792 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  31.34 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2044  ribosomal protein L13  29.41 
 
 		 142 aa  49.7  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000510712  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  30.25 
 
 		 143 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0500  50S ribosomal protein L13  29.85 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  26.87 
 
 		 142 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04085  50S ribosomal protein L13  26.77 
 
 		 151 aa  49.3  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  26.87 
 
 		 142 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  27.82 
 
 		 142 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  29.92 
 
 		 150 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2638  50S ribosomal protein L13  31.34 
 
 		 147 aa  48.9  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107212  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0055  50S ribosomal protein L13  29.46 
 
 		 146 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00159664  normal  0.826314 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  27.82 
 
 		 142 aa  49.3  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  30.25 
 
 		 143 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  27.82 
 
 		 142 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  30.51 
 
 		 145 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  30.51 
 
 		 145 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  30.51 
 
 		 145 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  30.51 
 
 		 145 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  30.51 
 
 		 145 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  28.24 
 
 		 148 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>