More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2099 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  100 
 
 		 186 aa  369  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  73.12 
 
 		 186 aa  292  2e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  74.73 
 
 		 185 aa  290  1e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  75 
 
 		 182 aa  282  2.0000000000000002e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  50.57 
 
 		 179 aa  190  9e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 154 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  40.29 
 
 		 140 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  42.66 
 
 		 139 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  40.85 
 
 		 136 aa  97.1  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  40.85 
 
 		 202 aa  95.9  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  45.36 
 
 		 137 aa  92  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  35.81 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  35.97 
 
 		 138 aa  90.9  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  43.93 
 
 		 140 aa  90.1  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  39.16 
 
 		 140 aa  89  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  33.79 
 
 		 149 aa  87  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  41.28 
 
 		 140 aa  87  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  37.32 
 
 		 147 aa  87.4  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  48 
 
 		 137 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  44.33 
 
 		 137 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  48 
 
 		 137 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  42.2 
 
 		 140 aa  85.5  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  36.73 
 
 		 148 aa  85.1  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  33.33 
 
 		 138 aa  85.1  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  38.73 
 
 		 151 aa  84.7  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  36.36 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  36.17 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  37.24 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  39.45 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  42.59 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  35.14 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  35.88 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  33.56 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  35.96 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0737  50S ribosomal protein L13  38.05 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.664104  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0911  50S ribosomal protein L13  38.05 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  35.96 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1653  50S ribosomal protein L13  38.05 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1473  50S ribosomal protein L13  38.05 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00205276  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1827  50S ribosomal protein L13  37.17 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000510048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  37.5 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0384  50S ribosomal protein L13  38.05 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.618287  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  32.03 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  36.43 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  33.04 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  36.44 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  36.61 
 
 		 154 aa  57  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  36.44 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4027  ribosomal protein L13  34.96 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.240454 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  40.18 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  32.74 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  40.18 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  34.45 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  33.93 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  34.82 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  33.62 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0387  50S ribosomal protein L13  33.91 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  32.17 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  38.76 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_002620  TC0401  50S ribosomal protein L13  38.94 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.245435  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  32.8 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  35.9 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  36.36 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  33.61 
 
 		 147 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  34.51 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  37.5 
 
 		 150 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  34.68 
 
 		 154 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  32.14 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  35.71 
 
 		 144 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0561  50S ribosomal protein L13  30.87 
 
 		 142 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224516  normal  0.196899 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2679  50S ribosomal protein L13  36.15 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200743  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  33.59 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  38.33 
 
 		 142 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  35.71 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2044  ribosomal protein L13  34.78 
 
 		 142 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000510712  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  34.56 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  29.46 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  32.74 
 
 		 143 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  34.56 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  34.82 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  32.09 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  33.33 
 
 		 148 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  34.11 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  36.13 
 
 		 151 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  32.81 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  31.9 
 
 		 148 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  33.09 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  33.61 
 
 		 145 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  30.95 
 
 		 147 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  29.85 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  34.06 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  38.98 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  30.6 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  33.04 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 143 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  33.93 
 
 		 145 aa  52.4  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  29.85 
 
 		 142 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>