More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2143 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  100 
 
 		 147 aa  288  2e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  66.2 
 
 		 149 aa  197  3.9999999999999996e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  39.29 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  44.68 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  44.29 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  44.29 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  42.55 
 
 		 140 aa  98.6  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  42.14 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  41.26 
 
 		 136 aa  96.7  9e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  38.97 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  44.06 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  40.43 
 
 		 138 aa  93.6  8e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  41.13 
 
 		 140 aa  93.6  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  40.43 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  41.43 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  38.03 
 
 		 185 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  38.03 
 
 		 182 aa  87.8  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  37.32 
 
 		 186 aa  87.4  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  37.59 
 
 		 151 aa  86.7  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  39.16 
 
 		 202 aa  85.9  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  35.71 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  40 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  40.15 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  39.39 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  37.86 
 
 		 149 aa  83.6  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  40 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  38.78 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  35.46 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  33.78 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  37.41 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  37.41 
 
 		 199 aa  77.4  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  36.11 
 
 		 201 aa  67  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.56 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  33.07 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1536  50S ribosomal protein L13  28.36 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000633501  normal  0.222947 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  29.37 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  30.08 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  31.75 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  32.54 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0384  50S ribosomal protein L13  30.43 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.618287  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  28.03 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0375  50S ribosomal protein L13  30.15 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.958432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  29.92 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  30.7 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1827  50S ribosomal protein L13  31.3 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000510048  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  30.08 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  31.75 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1653  50S ribosomal protein L13  30.43 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  31.75 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  31.75 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  31.75 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  31.75 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  31.75 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  31.75 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1473  50S ribosomal protein L13  30.43 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00205276  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  30.28 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  31.03 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  29.55 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl493  50S ribosomal protein L13  29.92 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.363056  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  27.56 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  34.13 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  32.06 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  28.79 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4027  ribosomal protein L13  31.71 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.240454 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  31.62 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  30.28 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  32.84 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0946  50S ribosomal protein L13  34.21 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000305629  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  30.36 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  32.46 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  27.82 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  32.46 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  27.82 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  30.53 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  27.91 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  28.24 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  27.87 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  29.51 
 
 		 142 aa  50.8  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0461  50S ribosomal protein L13  32.03 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  30 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  31.4 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  28.91 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  29.82 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  30.4 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  30.3 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0663  50S ribosomal protein L13  30.36 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.131584  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  28.03 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0852  50S ribosomal protein L13  31.54 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000022737  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0561  50S ribosomal protein L13  35.71 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224516  normal  0.196899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0889  50S ribosomal protein L13  29.46 
 
 		 147 aa  50.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  29.5 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  32.31 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  28.69 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  28.46 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  29.5 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  28.93 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>