More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0852 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0852  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 142 aa  289  9e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000022737  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0461  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797457  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  173  9e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  56.34 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  169  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  169  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0252  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000674786  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1941  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.62792e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  52.11 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  166  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  55.47 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 143 aa  164  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 144 aa  163  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 147 aa  163  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2044  ribosomal protein L13  50.7 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000510712  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  54.01 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  50.7 
 
 		 149 aa  160  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 144 aa  160  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0343  50S ribosomal protein L13  55.07 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00515724  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0649  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.71181e-17  normal  0.0947726 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  49.3 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2638  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107212  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0604  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 		 146 aa  158  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  157  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0625  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>