63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_26899 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  100 
 
 		 199 aa  414  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  47.74 
 
 		 200 aa  204  6e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  48.98 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  45.73 
 
 		 201 aa  193  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  47.22 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  37.06 
 
 		 140 aa  94.4  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  39.72 
 
 		 138 aa  94  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  40.43 
 
 		 139 aa  91.3  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  36.11 
 
 		 140 aa  90.1  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  34.72 
 
 		 140 aa  89.4  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  32.9 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  40.65 
 
 		 154 aa  84.3  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  34.03 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  35.15 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  34.81 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  38.14 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  33.33 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  31.94 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  35.88 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  34.27 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  33.33 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  33.33 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  36.44 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  31.94 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  32.73 
 
 		 182 aa  72  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  34.01 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  30.07 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  31.97 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  32.79 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  33.06 
 
 		 137 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  33.56 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  27.59 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  28.69 
 
 		 137 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  33.06 
 
 		 147 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  31.4 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  31.82 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  30 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  27.91 
 
 		 148 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 145 aa  45.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  33.05 
 
 		 151 aa  45.8  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  31.67 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  27.5 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  30 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  28.36 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  30.58 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  27.34 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  31.58 
 
 		 142 aa  42.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  30.83 
 
 		 150 aa  42.4  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  28.89 
 
 		 144 aa  42.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  28.93 
 
 		 148 aa  42.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1612  50S ribosomal protein L13  31.3 
 
 		 151 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0318086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  28.23 
 
 		 149 aa  42  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  27.73 
 
 		 142 aa  42  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  29.75 
 
 		 142 aa  41.6  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1909  ribosomal protein L13  27.73 
 
 		 142 aa  42  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  28.33 
 
 		 143 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  26.83 
 
 		 143 aa  41.6  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  30 
 
 		 147 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  29.1 
 
 		 142 aa  41.2  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  28.06 
 
 		 149 aa  41.2  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  27.97 
 
 		 170 aa  41.2  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  30.37 
 
 		 145 aa  41.2  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  28.36 
 
 		 142 aa  41.2  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>