More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1050 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  100 
 
 		 149 aa  292  8e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  66.2 
 
 		 147 aa  197  3.9999999999999996e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  43.07 
 
 		 179 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  42.55 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  42.14 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  42.86 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  39.57 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  38.19 
 
 		 182 aa  95.9  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  42.14 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  36.62 
 
 		 154 aa  94.7  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  32.64 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  40.85 
 
 		 140 aa  93.6  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  35.14 
 
 		 185 aa  90.5  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  37.68 
 
 		 136 aa  90.1  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  36.55 
 
 		 202 aa  89.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  37.09 
 
 		 151 aa  89.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  35.81 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  40.43 
 
 		 140 aa  88.6  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  37.86 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  33.79 
 
 		 186 aa  87  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  33.97 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  35.57 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  37.86 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  42.97 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  34.03 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  41.54 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  36 
 
 		 199 aa  80.9  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  41.54 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  36.55 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  34.46 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  40.15 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  31.43 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  29.29 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  33.33 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  30.43 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  27.74 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  29.29 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  28.21 
 
 		 154 aa  62  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  29.1 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  28.99 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0375  50S ribosomal protein L13  30.23 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.958432 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  28.37 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  32.41 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  28.99 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  26.35 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1536  50S ribosomal protein L13  27.07 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000633501  normal  0.222947 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  29.63 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  32.84 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  32.84 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  27.41 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  26.97 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  30.47 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  27.59 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  28.68 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  32.8 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  27.13 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0384  50S ribosomal protein L13  31.97 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.618287  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  30.23 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  28 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  27.94 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  23.53 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1827  50S ribosomal protein L13  32.79 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000510048  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1941  ribosomal protein L13  25.4 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  27.01 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  27.61 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  29.01 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  27.08 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0401  50S ribosomal protein L13  31.3 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.245435  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1653  50S ribosomal protein L13  31.97 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  25.37 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  27.92 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  26.28 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  28.28 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  27.13 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  27.94 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0946  50S ribosomal protein L13  28.47 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000305629  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  26.83 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1473  50S ribosomal protein L13  31.97 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00205276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  27.69 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0852  50S ribosomal protein L13  33.33 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000022737  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0049  ribosomal protein L13  21.9 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  28.68 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  31.45 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04085  50S ribosomal protein L13  27.41 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  25 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  26.28 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  28.68 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  22.79 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  28.57 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  25.93 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  29.13 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  25.74 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  26.67 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  27.41 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  25.98 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  29.13 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  29.51 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  29.1 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  28.57 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>