More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1653 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1653  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 141 aa  291  2e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1827  50S ribosomal protein L13  99.29 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000510048  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1473  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00205276  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0384  50S ribosomal protein L13  97.16 
 
 		 142 aa  285  2e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.618287  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0911  50S ribosomal protein L13  89.44 
 
 		 142 aa  261  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0737  50S ribosomal protein L13  88.03 
 
 		 142 aa  258  2e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.664104  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0387  50S ribosomal protein L13  86.52 
 
 		 141 aa  250  4.0000000000000004e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1597  50S ribosomal protein L13  76.6 
 
 		 141 aa  233  6e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219033  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1909  ribosomal protein L13  73.53 
 
 		 142 aa  214  2.9999999999999998e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0092  50S ribosomal protein L13  67.39 
 
 		 140 aa  208  3e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0461  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 142 aa  166  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797457  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  58.46 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  57.46 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  58.21 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  55.15 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  57.46 
 
 		 144 aa  160  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  56.2 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  57.46 
 
 		 163 aa  160  6e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  54.35 
 
 		 144 aa  159  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 		 142 aa  159  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  54.74 
 
 		 143 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  55.64 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  56.72 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  53.28 
 
 		 143 aa  158  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  54.14 
 
 		 143 aa  158  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  54.41 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  55.07 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  54.74 
 
 		 143 aa  157  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  57.69 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  52.9 
 
 		 148 aa  157  6e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  156  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  55.38 
 
 		 149 aa  156  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  55.22 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 145 aa  155  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  55.22 
 
 		 148 aa  155  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  52.94 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  55.64 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  55.38 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  56.92 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  56.59 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  54.74 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  52.55 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 		 145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  56.92 
 
 		 145 aa  153  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 142 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  52.55 
 
 		 151 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 142 aa  153  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  55.81 
 
 		 143 aa  153  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  54.07 
 
 		 144 aa  153  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 149 aa  153  8e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 		 145 aa  153  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 144 aa  153  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 149 aa  153  8e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2044  ribosomal protein L13  54.89 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000510712  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  53.08 
 
 		 147 aa  153  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 144 aa  153  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  53.08 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  55.81 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  54.81 
 
 		 146 aa  152  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>