More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_15678 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009360  OSTLU_15678  Plastid ribosomal protein L13 large ribosomal subunit  100 
 
 		 218 aa  449  1e-125  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0368905  hitchhiker  0.00903198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  52.74 
 
 		 151 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 151 aa  150  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 150 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  48.99 
 
 		 151 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  48.99 
 
 		 151 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 143 aa  144  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2985  50S ribosomal protein L13  49.66 
 
 		 151 aa  144  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  46.1 
 
 		 150 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  46.1 
 
 		 150 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 143 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 143 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  47.65 
 
 		 151 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  50.68 
 
 		 149 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  49.32 
 
 		 170 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  46.62 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  50.38 
 
 		 151 aa  138  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  51.15 
 
 		 150 aa  137  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  48.23 
 
 		 150 aa  135  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  48.95 
 
 		 147 aa  135  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  50.71 
 
 		 147 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  49.3 
 
 		 146 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  47.52 
 
 		 143 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  46.9 
 
 		 150 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  50 
 
 		 154 aa  132  6e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  50.75 
 
 		 146 aa  132  6e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  48.57 
 
 		 150 aa  131  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  47.14 
 
 		 147 aa  131  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  47.14 
 
 		 143 aa  131  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  47.95 
 
 		 144 aa  130  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0561  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 142 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224516  normal  0.196899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  49.62 
 
 		 142 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  49.22 
 
 		 147 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 142 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  51.54 
 
 		 144 aa  129  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  48.48 
 
 		 143 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  51.97 
 
 		 143 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  51.18 
 
 		 142 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  45.89 
 
 		 145 aa  129  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  51.18 
 
 		 142 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  45.89 
 
 		 147 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  47.76 
 
 		 142 aa  128  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 154 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  48.59 
 
 		 154 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  46.85 
 
 		 148 aa  128  7.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  48.59 
 
 		 154 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  46.1 
 
 		 145 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1385  50S ribosomal protein L13  45.21 
 
 		 152 aa  128  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  49.62 
 
 		 142 aa  128  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  47.86 
 
 		 147 aa  127  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0880  ribosomal protein L13  49.64 
 
 		 147 aa  127  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  128  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  48.57 
 
 		 147 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  47.52 
 
 		 149 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  46.1 
 
 		 147 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  49.61 
 
 		 142 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  49.61 
 
 		 142 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  49.61 
 
 		 142 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  49.61 
 
 		 142 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  50.39 
 
 		 142 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  44.7 
 
 		 142 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  47.76 
 
 		 142 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  50.39 
 
 		 142 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  50.39 
 
 		 142 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  48.85 
 
 		 142 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  50.39 
 
 		 142 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  48.8 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  50.39 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0737  50S ribosomal protein L13  48.82 
 
 		 142 aa  126  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.664104  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  46.27 
 
 		 144 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 147 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  51.52 
 
 		 142 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1693  50S ribosomal protein L13  44.29 
 
 		 149 aa  126  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0818735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  45.39 
 
 		 145 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  48.87 
 
 		 144 aa  125  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  45.39 
 
 		 145 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  47.76 
 
 		 142 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  48.85 
 
 		 142 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  48.85 
 
 		 142 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  48.85 
 
 		 142 aa  125  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  49.61 
 
 		 143 aa  125  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  44.68 
 
 		 145 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  48.82 
 
 		 142 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  44.68 
 
 		 145 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  45.14 
 
 		 142 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  48.85 
 
 		 142 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  45.14 
 
 		 142 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  48.85 
 
 		 142 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  48.85 
 
 		 142 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  48.85 
 
 		 142 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  48.85 
 
 		 142 aa  125  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  44.68 
 
 		 145 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  48.85 
 
 		 142 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>