More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0015 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0015  ribosomal protein L13  100 
 
 		 144 aa  290  3e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2727  ribosomal protein L13  72.03 
 
 		 145 aa  206  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000734549  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  60 
 
 		 145 aa  174  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  60 
 
 		 144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 143 aa  171  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 163 aa  161  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  53.33 
 
 		 143 aa  160  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 142 aa  159  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  159  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  54.35 
 
 		 144 aa  158  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0869  ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 148 aa  158  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 142 aa  157  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  52.21 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  52.82 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 142 aa  157  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 142 aa  157  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 143 aa  157  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 144 aa  157  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 149 aa  157  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  54.29 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 142 aa  157  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 146 aa  156  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 149 aa  156  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1130  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1157  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.341835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1147  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 147 aa  155  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 154 aa  154  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  52.21 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 154 aa  154  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 		 147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  52.99 
 
 		 142 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  52.99 
 
 		 142 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  53.68 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  52.99 
 
 		 142 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  153  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  153  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  153  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 		 154 aa  153  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  153  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  153  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  51.47 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>