More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3476 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 350 aa  686    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  59.13 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  41.69 
 
 		 360 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  41.23 
 
 		 365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  43.23 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  44.25 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  42.77 
 
 		 353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  42.15 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  45.19 
 
 		 634 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  40 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  43.29 
 
 		 375 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  40.06 
 
 		 355 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  41.83 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.8 
 
 		 361 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  41.14 
 
 		 358 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.62 
 
 		 362 aa  203  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  41.31 
 
 		 360 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  40.49 
 
 		 364 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  42.72 
 
 		 377 aa  192  9e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  38.87 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  41.18 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  37.97 
 
 		 371 aa  186  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  37.54 
 
 		 359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  39.13 
 
 		 356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  37.75 
 
 		 374 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  37.75 
 
 		 374 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  37.75 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.42 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  43.56 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  42.12 
 
 		 384 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  36.39 
 
 		 359 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  36.96 
 
 		 1155 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  41.97 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  42.47 
 
 		 365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  38.89 
 
 		 372 aa  169  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  38.07 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  38.07 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  38.07 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.99 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  39.76 
 
 		 362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  38.92 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  36.08 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  37.01 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  38.14 
 
 		 418 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  38.14 
 
 		 418 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  38.14 
 
 		 418 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  37.31 
 
 		 352 aa  150  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  36.18 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  30.17 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  35.37 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.03 
 
 		 373 aa  126  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  37.92 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.95 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.35 
 
 		 382 aa  119  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21240  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.59 
 
 		 358 aa  116  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  32.69 
 
 		 343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  30.89 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  26.6 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  28.3 
 
 		 368 aa  107  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.68 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  36.36 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.45 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  30.45 
 
 		 334 aa  103  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  29.41 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  29.22 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  33.77 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  32.4 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  29.37 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  25.15 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  30.07 
 
 		 322 aa  100  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  30.69 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.21 
 
 		 354 aa  99.8  6e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  25.82 
 
 		 324 aa  99.8  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.37 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  30.95 
 
 		 322 aa  99  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  30.82 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  31.42 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  31.14 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  34.43 
 
 		 325 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  33.46 
 
 		 313 aa  97.8  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  33.08 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.47 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  31.78 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  32.18 
 
 		 359 aa  97.1  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  34.03 
 
 		 334 aa  97.1  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  30.19 
 
 		 323 aa  96.7  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0238  polyprenyl synthetase family protein  32.26 
 
 		 321 aa  97.1  5e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0405378  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  26.55 
 
 		 331 aa  96.3  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  29.28 
 
 		 325 aa  95.9  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  30.8 
 
 		 333 aa  95.9  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.2 
 
 		 322 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  32.52 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  31.32 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  27.61 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  32.06 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  30.74 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  29.24 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  30.54 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 325 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>