More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0880 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  425  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  54.1 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  52.2 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  40.76 
 
 		 225 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  38.07 
 
 		 278 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3340  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 209 aa  88.2  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3449  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 209 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0291  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.36 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3426  putative transcriptional regulator  31.64 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  56 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  34.13 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  35.06 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4449  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  42.25 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  25.87 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  37.65 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  42.86 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  42.86 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  42.86 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  42.86 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  42.86 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  42.86 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>