296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0808 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 222 aa  438  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0735  regulatory protein, TetR  43.88 
 
 		 204 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8740  putative transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2624  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.465145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6264  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.085092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1430  regulatory protein TetR  39.39 
 
 		 236 aa  87.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1125  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  55.36 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 266 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 202 aa  52.4  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 191 aa  52.4  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  41.67 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 299 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3705  regulatory protein TetR  27.68 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  41.94 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  29.76 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3163  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0081  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0649  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899851  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3913  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20842  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  33.01 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 207 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 257 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  29.7 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 205 aa  47  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4953  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281079  normal  0.71404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 176 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  37.29 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 193 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 199 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  43.64 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>