126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1561 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  100 
 
 
347 aa  682    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  76.59 
 
 
346 aa  541  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  67.85 
 
 
339 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  67.85 
 
 
339 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  71.66 
 
 
343 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  59.64 
 
 
289 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  49 
 
 
332 aa  292  5e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  43.18 
 
 
377 aa  257  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  42.43 
 
 
339 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  41.41 
 
 
366 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  36.82 
 
 
337 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  36.82 
 
 
337 aa  186  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  36.82 
 
 
337 aa  186  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  36.82 
 
 
337 aa  186  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  36.82 
 
 
337 aa  186  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  36.82 
 
 
337 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  36.82 
 
 
337 aa  186  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  36.82 
 
 
337 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  36.82 
 
 
337 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  36.14 
 
 
361 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  35.79 
 
 
366 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  35.79 
 
 
357 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  36.72 
 
 
338 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  35.58 
 
 
338 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  35.14 
 
 
339 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  35.38 
 
 
341 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  37 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  34.53 
 
 
332 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  35.38 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  35.38 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  35.38 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  35.38 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  35.38 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  33.61 
 
 
361 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  32.4 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  32.41 
 
 
374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  35.92 
 
 
343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  31.64 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  30.5 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  30.36 
 
 
390 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  29.29 
 
 
307 aa  95.9  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  31.32 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  28.18 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  31.09 
 
 
349 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  30.11 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  25.4 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  25.57 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  26 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  23.02 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14240  predicted membrane protein  26.99 
 
 
352 aa  67  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00629012  normal  0.0181744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  24.61 
 
 
375 aa  66.6  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  28.16 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  26.88 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  26.88 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  26.88 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  26.11 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  27.46 
 
 
324 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  21.33 
 
 
299 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  25.08 
 
 
306 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  26.8 
 
 
294 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  22.69 
 
 
360 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  25 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  26.22 
 
 
329 aa  57  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  24.84 
 
 
386 aa  56.6  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  25.09 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  29.76 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  23.62 
 
 
424 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  24.03 
 
 
450 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  22.93 
 
 
374 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  19.62 
 
 
324 aa  53.9  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  27.06 
 
 
300 aa  53.5  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  26.96 
 
 
424 aa  52.8  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3429  ribonuclease BN  26.45 
 
 
320 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  24.69 
 
 
352 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  22.41 
 
 
301 aa  50.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  23.36 
 
 
266 aa  50.4  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  24.18 
 
 
499 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  21.51 
 
 
307 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  21.43 
 
 
321 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  23.43 
 
 
367 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  23.89 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  23.89 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  23.38 
 
 
350 aa  48.9  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  23.66 
 
 
449 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  23.02 
 
 
396 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  20.94 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  24.14 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  23.79 
 
 
337 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  24.11 
 
 
368 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0817  ribonuclease BN  26.59 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  20.87 
 
 
442 aa  47.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  19.92 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  20.69 
 
 
304 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  24.02 
 
 
417 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  28.04 
 
 
445 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2672  ribonuclease BN  29.5 
 
 
266 aa  46.6  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.324554  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02750  YihY family protein  28.92 
 
 
360 aa  46.6  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  23 
 
 
538 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5288  ribonuclease BN  26.62 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  23.1 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>