More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0181 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0181  non-specific protein-tyrosine kinase  100 
 
 		 731 aa  1452    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6092  lipopolysaccharide biosynthesis protein  53.43 
 
 		 730 aa  551  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666238  decreased coverage  0.00184203 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  26.79 
 
 		 733 aa  201  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  26.88 
 
 		 756 aa  193  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.72 
 
 		 738 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  25.65 
 
 		 721 aa  181  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  26.94 
 
 		 789 aa  180  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 730 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  25.45 
 
 		 750 aa  167  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  22.66 
 
 		 745 aa  167  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  26.87 
 
 		 710 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  26.15 
 
 		 756 aa  162  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.81 
 
 		 743 aa  160  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  27.71 
 
 		 771 aa  158  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.19 
 
 		 739 aa  158  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  27.71 
 
 		 789 aa  158  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  25.54 
 
 		 734 aa  157  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 745 aa  156  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  26.11 
 
 		 772 aa  157  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 		 731 aa  153  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  24.3 
 
 		 737 aa  151  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  24.93 
 
 		 734 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  24.87 
 
 		 770 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  25.62 
 
 		 736 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  23.95 
 
 		 776 aa  147  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  27.13 
 
 		 753 aa  145  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  25.35 
 
 		 782 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.69 
 
 		 701 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  23.56 
 
 		 756 aa  145  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  25.11 
 
 		 788 aa  141  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  25.31 
 
 		 746 aa  140  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  25.12 
 
 		 774 aa  140  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  25.13 
 
 		 711 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  25.52 
 
 		 741 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1523  non-specific protein-tyrosine kinase  28.57 
 
 		 718 aa  136  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  28.34 
 
 		 747 aa  134  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  25.97 
 
 		 746 aa  134  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.57 
 
 		 779 aa  134  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  23.94 
 
 		 727 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  26.8 
 
 		 720 aa  134  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  21.08 
 
 		 726 aa  134  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  27.42 
 
 		 766 aa  133  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  24.36 
 
 		 723 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  21.43 
 
 		 772 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  27.27 
 
 		 744 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  26.35 
 
 		 720 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  26.35 
 
 		 720 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  26.35 
 
 		 720 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  26.35 
 
 		 720 aa  131  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  26.35 
 
 		 720 aa  131  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  26.35 
 
 		 720 aa  130  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 764 aa  130  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  26.35 
 
 		 720 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  26.35 
 
 		 719 aa  130  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.09 
 
 		 722 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 		 804 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  27.33 
 
 		 744 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  26.35 
 
 		 719 aa  129  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  26.35 
 
 		 719 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  23.68 
 
 		 753 aa  128  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  26.35 
 
 		 719 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  22.26 
 
 		 755 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  22.26 
 
 		 720 aa  127  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 		 776 aa  127  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  22.14 
 
 		 753 aa  127  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  28.75 
 
 		 720 aa  127  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  26.13 
 
 		 719 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  21.18 
 
 		 756 aa  126  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  25.11 
 
 		 727 aa  125  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 737 aa  125  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.87 
 
 		 724 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  29.91 
 
 		 764 aa  124  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.12 
 
 		 720 aa  124  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  24.37 
 
 		 778 aa  124  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  23.42 
 
 		 724 aa  124  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  28.76 
 
 		 735 aa  124  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.6 
 
 		 739 aa  123  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 750 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  28.1 
 
 		 726 aa  122  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  28.1 
 
 		 726 aa  122  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  28.1 
 
 		 726 aa  122  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  28.1 
 
 		 726 aa  122  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  28.1 
 
 		 726 aa  122  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  28.1 
 
 		 726 aa  122  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  28.1 
 
 		 726 aa  122  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.63 
 
 		 748 aa  121  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.34 
 
 		 730 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  26.67 
 
 		 723 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  21.99 
 
 		 795 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.45 
 
 		 696 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  28.1 
 
 		 726 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  25 
 
 		 741 aa  121  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  34.01 
 
 		 496 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  23.44 
 
 		 747 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 		 726 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  22.28 
 
 		 742 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4497  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.96 
 
 		 734 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.904654  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  24.74 
 
 		 724 aa  119  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  22.79 
 
 		 797 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  23.96 
 
 		 732 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>