More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1401 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4166  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  70.9 
 
 		 664 aa  910    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.522629  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1071  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  61.04 
 
 		 665 aa  758    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.998298 
 
 
-
 
NC_004310  BR0609  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  60 
 
 		 663 aa  751    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  81.23 
 
 		 666 aa  1080    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108903 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3411  cytochrome c-type biogenesis protein CycK  53.56 
 
 		 664 aa  648    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0438  cytochrome c assembly protein  61.56 
 
 		 660 aa  761    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1401  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 666 aa  1312    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0545424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3073  cytochrome c-type biogenesis protein cycK  60.62 
 
 		 659 aa  712    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.46047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1193  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  60.85 
 
 		 661 aa  749    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.157027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2669  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  58.52 
 
 		 663 aa  739    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0635  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  61.76 
 
 		 660 aa  753    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.181407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2232  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  61.61 
 
 		 660 aa  743    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3448  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  61.85 
 
 		 660 aa  755    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186269  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2132  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  61.08 
 
 		 660 aa  756    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1836  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  62.04 
 
 		 660 aa  758    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0373548  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1406  cytochrome c assembly protein  97.6 
 
 		 666 aa  1218    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.419457  normal  0.0330583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2003  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  61.09 
 
 		 660 aa  753    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.151037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1439  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  59.58 
 
 		 660 aa  743    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612264  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1364  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  59.55 
 
 		 667 aa  736    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220377  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0608  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  60.3 
 
 		 663 aa  753    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4431  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  72.22 
 
 		 660 aa  889    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.938091  normal  0.729062 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3775  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  53.19 
 
 		 666 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0941  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  57.27 
 
 		 660 aa  688    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.983495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0899  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  58.88 
 
 		 662 aa  653    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160202  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0922  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  61.77 
 
 		 662 aa  765    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0606088  normal  0.0314376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1681  cytochrome c assembly protein  97.6 
 
 		 666 aa  1229    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0360404  normal  0.640994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1657  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  61.32 
 
 		 661 aa  750    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.018137  normal  0.790644 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4051  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  53.19 
 
 		 666 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.663155  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0035  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  53.18 
 
 		 671 aa  628  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.836519  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3977  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  51.27 
 
 		 653 aa  626  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0556794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2152  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  50.45 
 
 		 662 aa  624  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1127  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  50.67 
 
 		 654 aa  600  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1169  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  51.05 
 
 		 656 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.291829 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0432  cytochrome c-type biogenesis protein CycK  48.39 
 
 		 659 aa  595  1e-169  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3891  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  50.38 
 
 		 658 aa  590  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109986  normal  0.46196 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1290  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  50.82 
 
 		 656 aa  572  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.595992 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2633  cytochrome c maturation protein, CcmF  50.82 
 
 		 656 aa  572  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0466385  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2854  cytochrome c assembly protein  47.5 
 
 		 657 aa  571  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1659  cytochrome c assembly protein  47.88 
 
 		 659 aa  566  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118924  normal  0.550296 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2932  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  51.36 
 
 		 659 aa  560  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.310329 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0398  cytochrome c-type biogenesis protein F  45.12 
 
 		 649 aa  532  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3999  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  48.75 
 
 		 658 aa  528  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.509835  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0040  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  43.89 
 
 		 657 aa  524  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1513  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  46.24 
 
 		 639 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1209  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  44.63 
 
 		 679 aa  520  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3251  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  43.98 
 
 		 677 aa  521  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2786  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  45.66 
 
 		 657 aa  521  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1378  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  45.22 
 
 		 639 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002846  cytochrome c heme lyase subunit CcmF  45.65 
 
 		 658 aa  512  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03069  Cytochrome c biogenesis factor  43.69 
 
 		 685 aa  514  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3566  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  44.84 
 
 		 660 aa  512  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0145214  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1640  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  44.19 
 
 		 651 aa  511  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0476911  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0218  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  45.11 
 
 		 659 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000250074  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1369  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  46.39 
 
 		 674 aa  502  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1392  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  45.93 
 
 		 656 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03130  hypothetical protein  45.03 
 
 		 660 aa  504  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1501  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  45.93 
 
 		 656 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.175478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0390  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  45.93 
 
 		 656 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.458476 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0585  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  46.54 
 
 		 665 aa  504  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4656  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  43.64 
 
 		 659 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.724675  hitchhiker  0.00321654 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2276  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  44.01 
 
 		 652 aa  502  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2390  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  45.85 
 
 		 653 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00175562  hitchhiker  0.0000318804 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4770  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  45.31 
 
 		 673 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3630  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  45.95 
 
 		 657 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0248  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  44.53 
 
 		 658 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00203639  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0193  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  43.88 
 
 		 658 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000108567  normal  0.0553743 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3019  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.3 
 
 		 653 aa  490  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0374  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  47 
 
 		 692 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720361 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4056  cytochrome c-type heme lyase CcmF  45.34 
 
 		 680 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4284  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  43.07 
 
 		 659 aa  488  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184466 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3386  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  45.66 
 
 		 656 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3388  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  45.95 
 
 		 657 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0609216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0943  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  45.17 
 
 		 661 aa  483  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1582  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  46.26 
 
 		 662 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2446  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  45.85 
 
 		 672 aa  485  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3990  cytochrome c assembly protein  47.32 
 
 		 641 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.186912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2419  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  45.14 
 
 		 651 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3847  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  46.7 
 
 		 657 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2852  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  45.85 
 
 		 672 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1743  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.02 
 
 		 681 aa  480  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.262796  normal  0.222748 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1411  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  45.95 
 
 		 694 aa  480  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1549  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  46.05 
 
 		 660 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347843 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1035  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.37 
 
 		 679 aa  478  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30400  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  47 
 
 		 657 aa  478  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1687  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  46.57 
 
 		 666 aa  476  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2723  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  45.07 
 
 		 651 aa  478  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3648  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  46.08 
 
 		 662 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1955  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  44.41 
 
 		 665 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0802  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  41.62 
 
 		 649 aa  474  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.73075  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0418  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  44.75 
 
 		 657 aa  472  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3996  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  45.35 
 
 		 664 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0231  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  43.01 
 
 		 659 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0182  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  43.65 
 
 		 656 aa  474  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00179413  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1211  cytochrome c-type biogenesis protein (CcmF)  46.47 
 
 		 661 aa  475  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0231  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.71 
 
 		 659 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0266  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.12 
 
 		 659 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3724  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  43.03 
 
 		 659 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00953615  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1390  cytochrome c assembly protein  44.65 
 
 		 655 aa  472  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.74825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4021  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  42.69 
 
 		 659 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000531805  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0229  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  43.39 
 
 		 659 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0413329  hitchhiker  0.00683756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>