190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0360 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0360  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0284  regulatory protein TetR  91.16 
 
 		 215 aa  362  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0328  transcriptional regulator, TetR family  90.7 
 
 		 215 aa  359  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.0897822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5326  TetR family transcriptional regulator  82.27 
 
 		 218 aa  325  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1812  TetR family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436202  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1338  TetR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 213 aa  214  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00412049  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1381  TetR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.637245  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2750  transcriptional regulator, TetR family  46.08 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2493  transcriptional regulator, TetR family  46.08 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1963  TetR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.538053  normal  0.517781 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1495  TetR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 219 aa  157  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12027  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2780  transcriptional regulator TetR family  46.12 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  31.98 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  27.5 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  29.95 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  22.22 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  25.25 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  26.8 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  26.64 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2606  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193859  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  26.42 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  23.83 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  27.53 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00480  transcriptional regulator TetR/acrR family  30.6 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  25.73 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  27.04 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 217 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  26.25 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  23.57 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  27.93 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3066  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  22.86 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>