247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3803 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3803  integrase family protein  100 
 
 		 368 aa  743    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4124  integrase family protein  56.2 
 
 		 385 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3869  integrase family protein  38.13 
 
 		 381 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0203  phage integrase family protein  38.01 
 
 		 353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5804  integrase family protein  38.48 
 
 		 417 aa  228  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.991993  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3365  phage integrase  36.97 
 
 		 412 aa  212  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3311  phage integrase  36.46 
 
 		 404 aa  210  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2413  phage integrase  32.84 
 
 		 400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.786857  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2257  phage integrase family protein  37.27 
 
 		 363 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0034941  normal  0.642714 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1905  integrase family protein  30.02 
 
 		 440 aa  142  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2501  integrase family protein  27.25 
 
 		 348 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.137002  normal  0.0538174 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  31.35 
 
 		 334 aa  95.9  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1721  phage integrase family protein  34.48 
 
 		 332 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3805  integrase  33.07 
 
 		 332 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0477  hypothetical protein  33.89 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15798 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0473  integrase family protein  25.94 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  31.25 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  32.28 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1170  integrase family protein  24.57 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.429636 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  27.17 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2692  phage integrase  25.85 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.344187  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  27.46 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  29.56 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  31.33 
 
 		 172 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0017  integrase family protein  30.11 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1492  phage integrase family protein  36.92 
 
 		 134 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  27.63 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  26.27 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  31.63 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  27.73 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  29.46 
 
 		 274 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  27.73 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  29.31 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  24.61 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  28.94 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1893  phage-related integrase  30.3 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  27.04 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  29.7 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  26.91 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3098  integrase family protein  28.79 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  28.49 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  27.36 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  26.72 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  41.1 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.06 
 
 		 305 aa  57  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  25.91 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  28.57 
 
 		 362 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  23.55 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  25.96 
 
 		 343 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  26.59 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.77 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0240  tyrosine recombinase XerC subunit  24.07 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.295303  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  28.57 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  30.24 
 
 		 369 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  28.22 
 
 		 320 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  24.61 
 
 		 379 aa  53.5  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  27.43 
 
 		 444 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  26.09 
 
 		 276 aa  53.1  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  26.97 
 
 		 412 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.72 
 
 		 299 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  28.44 
 
 		 338 aa  53.1  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.72 
 
 		 299 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  31.03 
 
 		 425 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  30.67 
 
 		 188 aa  52.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.23 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  28.12 
 
 		 275 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  28.4 
 
 		 291 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  29.76 
 
 		 298 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  24.04 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.23 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  27.55 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00310  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.71 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.23 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  27.08 
 
 		 251 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.23 
 
 		 299 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  26.42 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  24.21 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.23 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  23.57 
 
 		 270 aa  50.8  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0604  hypothetical protein  33.71 
 
 		 456 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.24 
 
 		 299 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  28.04 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6923  integrase family protein  30.04 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  28.04 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.24 
 
 		 300 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.21 
 
 		 299 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  24.79 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  24.51 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  25.66 
 
 		 324 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  29.26 
 
 		 430 aa  50.1  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  28.79 
 
 		 341 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  28.02 
 
 		 341 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.33 
 
 		 294 aa  50.1  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.7 
 
 		 299 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.61 
 
 		 277 aa  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  29.67 
 
 		 305 aa  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  23.18 
 
 		 284 aa  50.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  29.55 
 
 		 369 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  29.55 
 
 		 369 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  29.55 
 
 		 369 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>