More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1661 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1661  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 		 261 aa  542  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.342631 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5128  tryptophan synthase, alpha subunit  35.63 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.527063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2241  tryptophan synthase subunit alpha  36.58 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0338  tryptophan synthase subunit alpha  36.61 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.291967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  37.74 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0840  tryptophan synthase subunit alpha  37.02 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  35.77 
 
 		 261 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  34.1 
 
 		 265 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  33.88 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  34.48 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  34.15 
 
 		 261 aa  158  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  35.63 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  34.1 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0501  tryptophan synthase subunit alpha  36.44 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0623201  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  35.63 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  35.63 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  35.81 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  35.8 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  33.72 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  34.47 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  34.92 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 267 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  33.2 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  34.52 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0545  tryptophan synthase subunit alpha  34.73 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153756  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  37.34 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  33.86 
 
 		 272 aa  149  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  33.74 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  32.82 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  32.69 
 
 		 268 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  35.77 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  33.07 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  35.77 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  35.77 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2818  tryptophan synthase, alpha subunit  33.05 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  34.87 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  34.45 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  33.78 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3297  tryptophan synthase subunit alpha  36.82 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.754487 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1690  tryptophan synthase subunit alpha  33.2 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  33.86 
 
 		 268 aa  146  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1315  tryptophan synthase subunit alpha  32.08 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.52445  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  33.78 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  32.55 
 
 		 275 aa  145  5e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  34.31 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  32.89 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  35.37 
 
 		 269 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  32.24 
 
 		 262 aa  145  9e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  35.37 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0398  tryptophan synthase subunit alpha  30.58 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  34.3 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  33.76 
 
 		 700 aa  143  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0373  tryptophan synthase subunit alpha  30.58 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  34.01 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  34.69 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  33.6 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  33.05 
 
 		 271 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  31.6 
 
 		 279 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08026  tryptophan synthase alpha chain  34.03 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  29.81 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  35.86 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  31.71 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  34.02 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  33.88 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  35.54 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  34.96 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  34.47 
 
 		 280 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0683  tryptophan synthase subunit alpha  33.93 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.550176 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  33.94 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  34.41 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2466  tryptophan synthase subunit alpha  36.13 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  30.68 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  30.68 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  33.19 
 
 		 265 aa  142  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  33.78 
 
 		 268 aa  141  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  34.57 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  33.76 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  34.5 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  31.3 
 
 		 266 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  32.24 
 
 		 269 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  32.17 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1933  tryptophan synthase subunit alpha  34.09 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190779  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0786  tryptophan synthase subunit alpha  30.67 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0265474  normal  0.221599 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1610  tryptophan synthase subunit alpha  30.17 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  32.27 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  34.26 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  33.06 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  35.56 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0854  tryptophan synthase, alpha subunit  35.59 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  32.63 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  34.29 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  32.85 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  33.75 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  32.11 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  36.25 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  33.07 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1587  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000746649  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3190  tryptophan synthase, alpha subunit  32.34 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>