112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1915 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 128 aa  243  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  99.22 
 
 		 143 aa  241  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  93.75 
 
 		 143 aa  228  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  46.09 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  42.98 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  39.32 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  40.19 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  32.2 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  38.6 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3041  MarR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 171 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 171 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 190 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 147 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  28.93 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  30.89 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2043  transcriptional regulator, MarR family  36.28 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.831784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  32.71 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  34.31 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  35.59 
 
 		 292 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1124  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 303 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  28.71 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  28.71 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  28.71 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  28.71 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 191 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  28.71 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2394  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 148 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.629641  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 149 aa  43.5  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  29.81 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  30.91 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  24.8 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 164 aa  42.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3478  hypothetical protein  34.78 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00929426  hitchhiker  0.00647977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2971  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 183 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0980761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1625  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 154 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  27.59 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 177 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  35.71 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>