More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0133 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
393 aa  790    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  81.98 
 
 
395 aa  659    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  84.99 
 
 
393 aa  684    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  49.23 
 
 
402 aa  373  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31 
 
 
543 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.15 
 
 
1694 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
1276 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 
562 aa  150  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.94 
 
 
576 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  29.63 
 
 
573 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 
465 aa  143  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  31.83 
 
 
602 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 
955 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 
927 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 
4079 aa  136  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.88 
 
 
784 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.43 
 
 
1979 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.43 
 
 
707 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.27 
 
 
1138 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  26.83 
 
 
635 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
711 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.9 
 
 
730 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
878 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 
740 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 
1049 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
1069 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  25.48 
 
 
1056 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.17 
 
 
810 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 
366 aa  114  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
329 aa  113  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 
344 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
617 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.74 
 
 
1007 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.09 
 
 
397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 
3035 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.82 
 
 
292 aa  109  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  28.1 
 
 
1013 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27 
 
 
3560 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  24.4 
 
 
436 aa  106  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  26.95 
 
 
564 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.44 
 
 
2240 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.72 
 
 
632 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
523 aa  103  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.74 
 
 
465 aa  102  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.87 
 
 
1737 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
1067 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 
1297 aa  102  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
279 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 
591 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  30.29 
 
 
560 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  20.82 
 
 
747 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  20.33 
 
 
467 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 
465 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  22.43 
 
 
605 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.2 
 
 
1056 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 
4489 aa  99.8  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 
512 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 
414 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.46 
 
 
745 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.4 
 
 
758 aa  97.4  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  28.28 
 
 
417 aa  97.1  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
1421 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.33 
 
 
818 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  19.78 
 
 
784 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  20.79 
 
 
828 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 
375 aa  93.2  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.61 
 
 
466 aa  93.2  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.2 
 
 
1056 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 
589 aa  92  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 
935 aa  92  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  21.35 
 
 
466 aa  90.5  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  25.36 
 
 
623 aa  90.9  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  20.79 
 
 
828 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 
761 aa  90.5  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 
468 aa  90.1  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
615 aa  90.1  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 
466 aa  89.7  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 
1094 aa  89.7  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06745  TPR repeat protein  26.25 
 
 
463 aa  89.4  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  24.56 
 
 
519 aa  89.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  24.74 
 
 
314 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.35 
 
 
1022 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
409 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 
448 aa  89.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  19.57 
 
 
828 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.13 
 
 
1676 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  21.49 
 
 
561 aa  87.8  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  23.63 
 
 
1101 aa  87  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  22.72 
 
 
471 aa  87  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  21.49 
 
 
561 aa  87  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 
804 aa  87  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 
1276 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 
363 aa  86.7  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  23.21 
 
 
626 aa  86.7  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  24.59 
 
 
815 aa  85.9  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  21.37 
 
 
643 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  20.92 
 
 
620 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.43 
 
 
887 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
244 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>