More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0900 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0900  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
172 aa  346  1e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00123871  normal  0.293983 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 
543 aa  74.3  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 
4079 aa  70.9  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
1276 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.62 
 
 
878 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.58 
 
 
810 aa  68.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  39.58 
 
 
250 aa  67.4  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.76 
 
 
632 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 
562 aa  65.5  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  33.79 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
4489 aa  64.7  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  39.6 
 
 
927 aa  64.3  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.5 
 
 
1022 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  37.89 
 
 
560 aa  64.3  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
716 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.4 
 
 
818 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
1094 aa  63.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.97 
 
 
219 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  38.3 
 
 
523 aa  63.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  38.61 
 
 
715 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  37.23 
 
 
649 aa  62  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 
361 aa  61.6  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.67 
 
 
988 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  40.48 
 
 
3560 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
3035 aa  60.8  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
273 aa  60.8  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  34.34 
 
 
1154 aa  60.8  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 
243 aa  60.8  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  37.21 
 
 
1694 aa  60.8  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  37.78 
 
 
340 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  40.48 
 
 
392 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 
636 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 
639 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 
612 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  34.74 
 
 
875 aa  59.7  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
279 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  39.78 
 
 
602 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.51 
 
 
1056 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
732 aa  58.9  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 
266 aa  59.3  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
750 aa  58.9  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  36.47 
 
 
407 aa  58.9  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 
388 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 
388 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 
1737 aa  58.9  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 
1486 aa  59.3  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.21 
 
 
1056 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  30 
 
 
585 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 
643 aa  58.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.04 
 
 
784 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 
699 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
635 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
591 aa  58.2  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 
1276 aa  58.2  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 
637 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
471 aa  58.2  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  33.9 
 
 
576 aa  58.2  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
635 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
611 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  28.44 
 
 
743 aa  57.8  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
371 aa  57.8  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 
270 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 
244 aa  57.4  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.68 
 
 
465 aa  57  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  30.94 
 
 
417 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  34 
 
 
280 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 
270 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.89 
 
 
406 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  35.05 
 
 
620 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.89 
 
 
406 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.99 
 
 
626 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
614 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 
329 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.99 
 
 
614 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  35.04 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.79 
 
 
397 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 
1406 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.77 
 
 
308 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
614 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.99 
 
 
626 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 
425 aa  56.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
615 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 
761 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
614 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.99 
 
 
614 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  35.35 
 
 
887 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
1252 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.03 
 
 
689 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  34.34 
 
 
573 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
465 aa  55.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  35.11 
 
 
582 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 
349 aa  55.5  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.99 
 
 
626 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
213 aa  55.5  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.83 
 
 
836 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
833 aa  55.5  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 
620 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
1252 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
255 aa  55.1  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>