More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1361 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  78.6 
 
 
257 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  81.22 
 
 
257 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  81.22 
 
 
257 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  81.22 
 
 
257 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  51.15 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  49.76 
 
 
261 aa  156  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  40 
 
 
291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  39.76 
 
 
291 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  39.76 
 
 
291 aa  135  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  40 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  40 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  39.22 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  37.12 
 
 
299 aa  128  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  42.17 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  36.91 
 
 
291 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  39.39 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  37.8 
 
 
255 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  37.99 
 
 
252 aa  115  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  37.85 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  34.23 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  40.16 
 
 
271 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  39.11 
 
 
303 aa  109  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  35.32 
 
 
267 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  36.84 
 
 
263 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  40.71 
 
 
292 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  37.5 
 
 
254 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  37.7 
 
 
277 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  35.9 
 
 
282 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  35.48 
 
 
250 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  33.83 
 
 
277 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  30.83 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  36.33 
 
 
286 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  31.44 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  36.33 
 
 
266 aa  96.3  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  33.76 
 
 
302 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  41.75 
 
 
267 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  33.46 
 
 
268 aa  95.1  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  37.55 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  41.83 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  38.6 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  40.17 
 
 
296 aa  93.2  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  33.2 
 
 
268 aa  92.4  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  33.7 
 
 
331 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  31.43 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  35.81 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  38.46 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  38.46 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  35.89 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  30.6 
 
 
273 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  32.9 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  37.98 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  33.2 
 
 
272 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  32.94 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  36.54 
 
 
268 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  30.94 
 
 
273 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  32.19 
 
 
301 aa  86.3  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  32.55 
 
 
290 aa  85.5  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  37.32 
 
 
268 aa  85.1  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  32.67 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  33.58 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  39.6 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  38.53 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  38.05 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  37.2 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  31.66 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  30.11 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  38.53 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  32.76 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  37.5 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  37.5 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  31.91 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  37.02 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  33.2 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  36.55 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  35.52 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  30.56 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  36.76 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  36.44 
 
 
275 aa  78.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  25.59 
 
 
2798 aa  78.6  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  35.17 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  34.54 
 
 
272 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  35.34 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  34.81 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  34.81 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  33.72 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  34.39 
 
 
267 aa  75.5  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  36.24 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  34.68 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  28.85 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  27.98 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  33.91 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  26.62 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  28.73 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21290  predicted permease  37.07 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0210962 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0360  hypothetical protein  32.38 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  34.83 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  29.41 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  32.33 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  32.39 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>