More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0531 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  100 
 
 
215 aa  425  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  99.53 
 
 
234 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  99.53 
 
 
234 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  99.53 
 
 
234 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  98.14 
 
 
249 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  57.34 
 
 
259 aa  223  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  54.88 
 
 
248 aa  214  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  49.76 
 
 
253 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  48.15 
 
 
270 aa  185  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1697  regulatory proteins, IclR  98.89 
 
 
90 aa  174  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  47.14 
 
 
254 aa  171  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  46.26 
 
 
266 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  42.13 
 
 
252 aa  154  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  41.55 
 
 
279 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  44.33 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  41.36 
 
 
260 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  39.91 
 
 
257 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  38.43 
 
 
238 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
249 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
249 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  38.89 
 
 
256 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  40.28 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1008  regulatory proteins, IclR  56.14 
 
 
133 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0609886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  40.74 
 
 
264 aa  115  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
272 aa  115  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  34.72 
 
 
261 aa  114  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 
267 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4100  IclR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  35.19 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  37.96 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  38.89 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  33.66 
 
 
258 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
258 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  35.38 
 
 
299 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  36.62 
 
 
247 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  35.78 
 
 
262 aa  105  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 
256 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  31.09 
 
 
255 aa  105  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  28.31 
 
 
254 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3485  IclR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
276 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4044  IclR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
257 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  34.7 
 
 
254 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  34.38 
 
 
284 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  33.64 
 
 
272 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  31.66 
 
 
242 aa  99.8  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  35.29 
 
 
268 aa  99.4  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  35.18 
 
 
255 aa  98.6  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  34.91 
 
 
276 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
324 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
308 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
286 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.34 
 
 
259 aa  95.9  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  33.16 
 
 
255 aa  95.1  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  31.36 
 
 
261 aa  95.5  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  32.81 
 
 
265 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  28.33 
 
 
246 aa  94  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3839  transcriptional regulator, IclR family  33.49 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
246 aa  94  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
276 aa  93.2  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0504  transcriptional regulator, IclR family  32.29 
 
 
266 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
257 aa  92.4  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
267 aa  92  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  31.67 
 
 
271 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  32.32 
 
 
266 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.84 
 
 
260 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  32.12 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  31.67 
 
 
277 aa  89.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
267 aa  89.4  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  30.14 
 
 
259 aa  89.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  34.42 
 
 
284 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
261 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
269 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  34.03 
 
 
296 aa  88.6  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  29.23 
 
 
257 aa  88.6  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0541  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 
261 aa  88.6  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.765211  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.65 
 
 
277 aa  88.6  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4088  transcriptional regulator, IclR family  31.96 
 
 
275 aa  87.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.855439  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
256 aa  87.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  33.16 
 
 
249 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3699  IclR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
299 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258779  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
268 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0134  IclR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
365 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102301  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0617  IclR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
299 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0585  IclR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
299 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  0.0114736 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  30.43 
 
 
266 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  23.47 
 
 
251 aa  85.9  4e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  29.9 
 
 
257 aa  85.9  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2768  IclR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
299 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
263 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
263 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
263 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
262 aa  85.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
268 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
263 aa  85.5  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
250 aa  85.5  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
268 aa  85.1  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 
268 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>