169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3080 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  96.4 
 
 		 444 aa  810    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  82.21 
 
 		 444 aa  681    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 473 aa  922    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  70.14 
 
 		 439 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  66.67 
 
 		 437 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  65.89 
 
 		 432 aa  502  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  54.78 
 
 		 434 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  55.05 
 
 		 460 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  54.73 
 
 		 446 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  53.55 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  51.13 
 
 		 440 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  54.48 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  54.48 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  55.53 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  54.48 
 
 		 437 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  52.79 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  55.94 
 
 		 499 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  55.2 
 
 		 471 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  54.86 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  53.58 
 
 		 441 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  57.96 
 
 		 450 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  54.11 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  50.98 
 
 		 464 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  51.04 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  51.25 
 
 		 445 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  44.24 
 
 		 447 aa  343  4e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  43.66 
 
 		 414 aa  340  4e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  44.65 
 
 		 446 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  44.09 
 
 		 447 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  43.21 
 
 		 453 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  42.15 
 
 		 475 aa  334  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  44 
 
 		 451 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  44.09 
 
 		 447 aa  332  9e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  41.71 
 
 		 439 aa  329  7e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  43.33 
 
 		 451 aa  329  8e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  41.77 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  43.33 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  44 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  44.2 
 
 		 421 aa  327  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  43.77 
 
 		 413 aa  327  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  40.14 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  43.38 
 
 		 412 aa  319  5e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  41.86 
 
 		 441 aa  319  9e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  42.93 
 
 		 414 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  41.77 
 
 		 396 aa  311  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  41.07 
 
 		 490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  37.46 
 
 		 432 aa  239  5.999999999999999e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  38.44 
 
 		 484 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  37.21 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  33.71 
 
 		 937 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  33.71 
 
 		 937 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  34.12 
 
 		 892 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  27.92 
 
 		 757 aa  87.8  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  36.22 
 
 		 1263 aa  86.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  29.38 
 
 		 863 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32.09 
 
 		 867 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.18 
 
 		 1041 aa  83.2  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  31.72 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  33.92 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  35.06 
 
 		 1015 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 886 aa  76.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  34.44 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  31.58 
 
 		 242 aa  75.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  32.58 
 
 		 761 aa  74.7  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.9 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.37 
 
 		 1107 aa  73.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  28.73 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.01 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  25.15 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  24.23 
 
 		 713 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  34.26 
 
 		 791 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  31.45 
 
 		 528 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.01 
 
 		 476 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  30.48 
 
 		 1749 aa  60.8  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  33.59 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  33.14 
 
 		 1024 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  27.18 
 
 		 528 aa  57  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  32.17 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  29.71 
 
 		 580 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  36.43 
 
 		 648 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  25.6 
 
 		 1344 aa  54.7  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.21 
 
 		 653 aa  55.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  31.28 
 
 		 1088 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4631  leucine-rich repeat-containing protein  36.29 
 
 		 473 aa  54.3  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46664  predicted protein  29.31 
 
 		 554 aa  53.9  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  32.54 
 
 		 230 aa  54.3  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  26.97 
 
 		 467 aa  53.9  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  29.26 
 
 		 569 aa  53.9  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  31.29 
 
 		 291 aa  53.5  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  34.48 
 
 		 675 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  31.21 
 
 		 1744 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62257  predicted protein  36.62 
 
 		 854 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.374999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  34.48 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  23.56 
 
 		 263 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  29.2 
 
 		 559 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38832  predicted protein  28 
 
 		 372 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00223865  hitchhiker  0.00603177 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  25.5 
 
 		 384 aa  51.2  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  28.87 
 
 		 647 aa  51.2  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  39.02 
 
 		 2132 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  21.01 
 
 		 204 aa  50.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>