More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1480 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  100 
 
 		 387 aa  768    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  94.32 
 
 		 387 aa  721    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  80.1 
 
 		 405 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  60.5 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  54.97 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  52.26 
 
 		 388 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  53 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  54.08 
 
 		 386 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  53.14 
 
 		 378 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  48.47 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  48.18 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  47.78 
 
 		 391 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  46.75 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  42.74 
 
 		 405 aa  353  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  47.23 
 
 		 389 aa  348  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  48.46 
 
 		 389 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  44.62 
 
 		 385 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  47.62 
 
 		 389 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  42.98 
 
 		 394 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  42.38 
 
 		 383 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  42.66 
 
 		 417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  49.28 
 
 		 389 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  43.26 
 
 		 394 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  42.94 
 
 		 417 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  49 
 
 		 389 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  49 
 
 		 389 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  41.69 
 
 		 401 aa  340  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  42.49 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  43.06 
 
 		 394 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  40.62 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  42.71 
 
 		 385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  44.44 
 
 		 383 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  43.18 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  39.9 
 
 		 396 aa  331  1e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  43.57 
 
 		 385 aa  331  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  47.52 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  46.96 
 
 		 379 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  47.08 
 
 		 387 aa  322  7e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  46.24 
 
 		 401 aa  321  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  43.66 
 
 		 377 aa  320  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  43.1 
 
 		 377 aa  320  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  46.85 
 
 		 380 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  43.38 
 
 		 377 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  47.18 
 
 		 380 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  42.82 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  43.08 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  42.82 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  43.08 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  43.38 
 
 		 377 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  43.1 
 
 		 377 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  43.1 
 
 		 377 aa  316  5e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  42.82 
 
 		 377 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  46.61 
 
 		 380 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  44.57 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  48.37 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  43.54 
 
 		 392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  34.79 
 
 		 381 aa  223  3e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  29.79 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  29.52 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  27.3 
 
 		 494 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  27.62 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  27.81 
 
 		 373 aa  90.9  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  28.26 
 
 		 460 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  27.33 
 
 		 381 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  27.96 
 
 		 375 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  26.02 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  30.38 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  21.1 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.34 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  22.04 
 
 		 513 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  21.93 
 
 		 513 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  25.77 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  26.72 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  26.99 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.99 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  26.99 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.99 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  31.77 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  27.23 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  25.59 
 
 		 513 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.99 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.19 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  30.57 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  31.25 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  30.57 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  29.49 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  27.84 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  26.1 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  29.97 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.89 
 
 		 834 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  22.28 
 
 		 513 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  24.03 
 
 		 603 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  26.57 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  22.34 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  31.37 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  23.75 
 
 		 514 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  30.57 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.94 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  31.03 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  29.96 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>