More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4084 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  53.13 
 
 		 610 aa  670    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  51.72 
 
 		 622 aa  669    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  54.44 
 
 		 622 aa  685    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4084  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 622 aa  1275    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  49.48 
 
 		 670 aa  560  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  48.1 
 
 		 614 aa  552  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  47.47 
 
 		 635 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3366  extracellular solute-binding protein  48.53 
 
 		 619 aa  549  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  46.91 
 
 		 641 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0514  extracellular solute-binding protein family 5  48.03 
 
 		 617 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772903  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  46.15 
 
 		 631 aa  545  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0342  extracellular solute-binding protein  46.46 
 
 		 637 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3729  extracellular solute-binding protein  47.55 
 
 		 605 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  47.04 
 
 		 631 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  46.46 
 
 		 637 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  46.7 
 
 		 631 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0421  extracellular solute-binding protein family 5  45.68 
 
 		 641 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  47.72 
 
 		 621 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2632  extracellular solute-binding protein  47.04 
 
 		 638 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  44.96 
 
 		 659 aa  531  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4446  extracellular solute-binding protein family 5  45.7 
 
 		 610 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4132  extracellular solute-binding protein family 5  44.46 
 
 		 610 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0244  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  43.67 
 
 		 631 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  44.01 
 
 		 613 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  45.68 
 
 		 609 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  44.98 
 
 		 600 aa  508  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  45.58 
 
 		 615 aa  504  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  44.68 
 
 		 611 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  44.85 
 
 		 611 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  43.95 
 
 		 611 aa  501  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  44.85 
 
 		 611 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  45.64 
 
 		 633 aa  497  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  44.5 
 
 		 611 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  43.83 
 
 		 607 aa  491  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  45.44 
 
 		 615 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  42.09 
 
 		 603 aa  483  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  43.86 
 
 		 618 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  44.72 
 
 		 613 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.04 
 
 		 618 aa  475  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  43.05 
 
 		 615 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.06 
 
 		 628 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  43.44 
 
 		 615 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  39.97 
 
 		 606 aa  448  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  40.7 
 
 		 609 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  40.78 
 
 		 602 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  40.7 
 
 		 609 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3093  extracellular solute-binding protein  42.15 
 
 		 640 aa  435  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  40.35 
 
 		 590 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.04 
 
 		 609 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  41.22 
 
 		 609 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  40.7 
 
 		 646 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0845  extracellular solute-binding protein  39.93 
 
 		 638 aa  425  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0910462 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  40.52 
 
 		 610 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  40.48 
 
 		 626 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  40.52 
 
 		 609 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  40.49 
 
 		 658 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4153  ABC transporter substrate-binding protein  39.37 
 
 		 601 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  40.18 
 
 		 597 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1397  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 		 606 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982775  normal  0.886089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  39.51 
 
 		 616 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  39.2 
 
 		 626 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  39.2 
 
 		 609 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2711  ABC transporter, periplamic substrate-binding protein  36.84 
 
 		 602 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2847  extracellular solute-binding protein  38.7 
 
 		 623 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1497  ABC transporter periplamic substrate-binding protein  37.01 
 
 		 602 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2786  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 		 602 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426757  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0422  extracellular solute-binding protein family 5  39.2 
 
 		 625 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1964  extracellular solute-binding protein  40.52 
 
 		 627 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2094  extracellular solute-binding protein  40.52 
 
 		 627 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2420  extracellular solute-binding protein  39.27 
 
 		 601 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0712361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  38.02 
 
 		 626 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  37.56 
 
 		 615 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  38.53 
 
 		 614 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  37.46 
 
 		 627 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5371  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  39.76 
 
 		 623 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  38.47 
 
 		 611 aa  393  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2741  extracellular solute-binding protein family 5  39.83 
 
 		 598 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.982648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1383  extracellular solute-binding protein  38.07 
 
 		 640 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3914  extracellular solute-binding protein family 5  38.37 
 
 		 630 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2941  extracellular solute-binding protein family 5  37.36 
 
 		 626 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1173  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  38.94 
 
 		 625 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000592479  normal  0.415148 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1607  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.31 
 
 		 650 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00266452  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2129  extracellular solute-binding protein  38.89 
 
 		 627 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.641802  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1510  extracellular solute-binding protein  37.4 
 
 		 620 aa  392  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.14042  normal  0.0541168 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  37.4 
 
 		 616 aa  392  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3204  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.31 
 
 		 650 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0292064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1014  extracellular solute-binding protein family 5  37.4 
 
 		 628 aa  392  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.517437  normal  0.0342428 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1382  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.31 
 
 		 650 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2017  extracellular solute-binding protein  40.1 
 
 		 604 aa  391  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2547  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.48 
 
 		 650 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.524722  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.48 
 
 		 650 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2432  extracellular solute-binding protein family 5  35.96 
 
 		 603 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2635  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.48 
 
 		 686 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2109  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.41 
 
 		 936 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.556934  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2326  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  36.15 
 
 		 604 aa  388  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440714 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1214  extracellular solute-binding protein  39.69 
 
 		 627 aa  389  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454357 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1733  extracellular solute-binding protein family 5  37.24 
 
 		 600 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6015  extracellular solute-binding protein  39.24 
 
 		 624 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2475  ABC transporter, peripllasmic solute-binding proteins  35.9 
 
 		 604 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2062  extracellular solute-binding protein  39.24 
 
 		 624 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>