254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2813 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  50 
 
 		 248 aa  214  8e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  42.37 
 
 		 237 aa  155  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  37.61 
 
 		 242 aa  151  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  38.7 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  36.53 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  34.7 
 
 		 234 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  34.7 
 
 		 234 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  34.7 
 
 		 234 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  34.7 
 
 		 234 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  34.7 
 
 		 234 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  36.07 
 
 		 234 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  36.07 
 
 		 234 aa  144  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  36.07 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  34.25 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  36.07 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  36.24 
 
 		 248 aa  139  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  37.27 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  35.62 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  39.46 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  36.84 
 
 		 238 aa  131  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  36.86 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  37.27 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  34.48 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  35.45 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  34.65 
 
 		 270 aa  124  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  34.8 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  34.32 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  38.66 
 
 		 266 aa  122  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  34.82 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  30.9 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  34.82 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  31.58 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  31.25 
 
 		 238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  37.22 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  34.8 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  30.51 
 
 		 221 aa  99  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  33.01 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  34.57 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  30.73 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  30.73 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  28.14 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  31.41 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  32.91 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  32.41 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  32.31 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  31 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  29.17 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  31.43 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  29.2 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  28.7 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  27.62 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  23.38 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  30.38 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3624  LmbE family protein  32.91 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  29.11 
 
 		 350 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  31.03 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  28.5 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  29.95 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  34.31 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  30.04 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  28.89 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  37.91 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  30.77 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  34.24 
 
 		 250 aa  68.2  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  31.42 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  30.59 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  26.44 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  33.05 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  30.85 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  29.91 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  31.75 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  33.57 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  30.36 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  26.54 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  31.22 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  26.87 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  27.1 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  35.38 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  35.38 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  35.77 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  35.38 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  35.38 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  35.38 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  27.13 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  28.76 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  30.53 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  35.77 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  28.26 
 
 		 272 aa  62  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  27.27 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  34.92 
 
 		 277 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  30 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  27.78 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  28.09 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  27.31 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  22.75 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1416  LmbE family protein  32.03 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  30 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  31.62 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  31.14 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>