144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2811 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2811  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 141 aa  280  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  65.96 
 
 		 140 aa  183  8e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2675  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1072  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885065  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0304  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.272256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  30.93 
 
 		 163 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  37.18 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 168 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 171 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  31.65 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 172 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1929  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0438098  normal  0.235011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 181 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 175 aa  43.9  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  30 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1496  transcriptional regulator, MarR family  27.4 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000613128  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 164 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 164 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 164 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 164 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 164 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 164 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 164 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  34.35 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  36.78 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  36.78 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  36.78 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  36.78 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  38.46 
 
 		 292 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  24.59 
 
 		 153 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 167 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 151 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 151 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 155 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 166 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 150 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 189 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 135 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 167 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>