More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2078 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2078  inner-membrane translocator  100 
 
 		 350 aa  659    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1245  inner-membrane translocator  95.09 
 
 		 350 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.138626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3150  inner-membrane translocator  59.08 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.35673 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5418  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  62.68 
 
 		 348 aa  358  9e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  41.8 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  41.08 
 
 		 364 aa  195  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.77 
 
 		 355 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.67 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4347  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 364 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 361 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.47 
 
 		 367 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0527  inner-membrane translocator  44.3 
 
 		 378 aa  156  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 362 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  39.26 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  37.92 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  27.95 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  38.97 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 363 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  40.62 
 
 		 347 aa  152  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  36.45 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 354 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 369 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  34.91 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  38.7 
 
 		 364 aa  150  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  37.81 
 
 		 371 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 361 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 363 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 362 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  41.92 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  35.25 
 
 		 387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  38.41 
 
 		 363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.87 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 347 aa  146  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 349 aa  146  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  41.67 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  39.2 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 368 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4234  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.14 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  34.72 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4849  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  34.16 
 
 		 365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  36 
 
 		 355 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  35.98 
 
 		 357 aa  139  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  37.21 
 
 		 371 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  32.84 
 
 		 368 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  34.4 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  34.4 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  34.38 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 369 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.76 
 
 		 471 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 369 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  39.68 
 
 		 362 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  32.64 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  31.74 
 
 		 366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 364 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4475  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 375 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.973671 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  35.77 
 
 		 365 aa  126  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  33.81 
 
 		 361 aa  125  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  36.17 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  30.98 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  31.16 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  35.34 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>