More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2274 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
167 aa  340  7e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  44.86 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 
152 aa  89  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  35.42 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  36.46 
 
 
162 aa  61.6  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  24.48 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  25.32 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
152 aa  54.7  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
160 aa  54.3  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 
189 aa  53.9  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 
155 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  29.55 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  31.07 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 
150 aa  52  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  32.1 
 
 
157 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
159 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 
159 aa  51.2  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1523  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
176 aa  50.8  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.7127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  28.33 
 
 
140 aa  50.8  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6436  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 
153 aa  50.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.408457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
142 aa  50.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  29.17 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  28.92 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1368  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
172 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  40.79 
 
 
157 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  23.61 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 
196 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 
168 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  31.75 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  46.15 
 
 
172 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
139 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  34.45 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 
158 aa  48.5  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 
154 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
148 aa  48.5  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 
169 aa  48.5  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2642  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
143 aa  48.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
137 aa  48.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  33.33 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  23.61 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  30.3 
 
 
161 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  23.61 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 
162 aa  48.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
156 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  39.34 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
156 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 
156 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  27.88 
 
 
154 aa  48.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2663  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 
138 aa  48.1  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.6589700000000003e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  29.9 
 
 
160 aa  47.8  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 
165 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
156 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
151 aa  47.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
153 aa  47.8  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 
146 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
142 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
142 aa  47.4  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
142 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>