More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1074 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1074  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 395 aa  798    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0868741  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  40.43 
 
 		 358 aa  226  7e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00593  MscS Mechanosensitive ion channel  35.9 
 
 		 356 aa  209  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.863063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  35.11 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 		 600 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 563 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 563 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  31.75 
 
 		 545 aa  113  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 572 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  26.51 
 
 		 571 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  26.22 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  30.59 
 
 		 550 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  29.63 
 
 		 524 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1474  MscS Mechanosensitive ion channel  27.08 
 
 		 559 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 		 566 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  29.95 
 
 		 579 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  26.77 
 
 		 593 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 230 aa  94.4  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  27.53 
 
 		 557 aa  92.8  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  26.23 
 
 		 481 aa  90.1  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  25.54 
 
 		 545 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  27.14 
 
 		 542 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  32.13 
 
 		 563 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  24.56 
 
 		 545 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  32.13 
 
 		 563 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 		 556 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  28.77 
 
 		 545 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  28.77 
 
 		 545 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  25.21 
 
 		 570 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  25.73 
 
 		 581 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1278  small-conductance mechanosensitive channel-like  28.4 
 
 		 520 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  27.88 
 
 		 538 aa  84  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  24.82 
 
 		 840 aa  79.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  27.27 
 
 		 847 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 847 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  28.75 
 
 		 849 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  24.66 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  28.48 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  27.88 
 
 		 753 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  24.8 
 
 		 796 aa  69.3  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  25.11 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 		 1072 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 		 1072 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 		 1072 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 		 1067 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  26.15 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  25.62 
 
 		 830 aa  67  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  26.44 
 
 		 1080 aa  67  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 1067 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  28.08 
 
 		 1067 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 1067 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3321  MscS mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 1078 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.660513  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 1067 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  25 
 
 		 807 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  26.24 
 
 		 1068 aa  63.2  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  28.85 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  26.25 
 
 		 1158 aa  63.2  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  26.07 
 
 		 1111 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  28.02 
 
 		 275 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  24.72 
 
 		 636 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4182  MscS mechanosensitive ion channel  27.64 
 
 		 1070 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  26.55 
 
 		 294 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  26.11 
 
 		 636 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  25.11 
 
 		 825 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  27.54 
 
 		 280 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  30.05 
 
 		 1117 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  23.58 
 
 		 806 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  26.11 
 
 		 877 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3551  MscS mechanosensitive ion channel  26.13 
 
 		 1062 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  25.98 
 
 		 531 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  24.12 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1730  MscS Mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.351236  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 1166 aa  61.6  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 1066 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  26.36 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  26.34 
 
 		 732 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  27.57 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  25.31 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2641  MscS Mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  30.73 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  28.28 
 
 		 682 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  25.99 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  30.1 
 
 		 794 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  23.36 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  27.69 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  21.31 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  25 
 
 		 289 aa  59.7  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2090  hypothetical protein  27.01 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  29.7 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  29.43 
 
 		 279 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.04 
 
 		 280 aa  59.3  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4940  potassium efflux protein KefA  33.61 
 
 		 1102 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>