More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2968 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  100 
 
 
493 aa  995    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  42.01 
 
 
825 aa  319  7.999999999999999e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.34 
 
 
1186 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  43.75 
 
 
454 aa  276  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  40.76 
 
 
1328 aa  268  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  41.84 
 
 
1215 aa  257  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.16 
 
 
885 aa  238  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.65 
 
 
771 aa  238  3e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.47 
 
 
787 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.5 
 
 
1424 aa  233  7.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 
991 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  38.38 
 
 
1039 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
843 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.84 
 
 
568 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  40.84 
 
 
568 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  36.05 
 
 
732 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  34.47 
 
 
924 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  33.75 
 
 
725 aa  207  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  35.39 
 
 
1288 aa  206  6e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.36 
 
 
767 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  39.9 
 
 
911 aa  206  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  35.26 
 
 
1507 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  29.71 
 
 
2145 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  40.13 
 
 
362 aa  199  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  30.6 
 
 
919 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  41.4 
 
 
751 aa  197  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  35.87 
 
 
1044 aa  196  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  33.25 
 
 
1105 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  34.76 
 
 
1131 aa  187  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  28.09 
 
 
1550 aa  182  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  37.75 
 
 
444 aa  181  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  41.57 
 
 
284 aa  180  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  45.81 
 
 
919 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  33.8 
 
 
799 aa  177  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  41.22 
 
 
977 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  34.1 
 
 
822 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  40.83 
 
 
311 aa  162  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  41.94 
 
 
481 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  39.01 
 
 
672 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  37.87 
 
 
949 aa  160  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  27.53 
 
 
1404 aa  159  1e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  39.62 
 
 
785 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 
1290 aa  156  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  44.39 
 
 
212 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  38.3 
 
 
814 aa  152  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  28.5 
 
 
740 aa  152  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  27.87 
 
 
1262 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  28.05 
 
 
1040 aa  147  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  38.96 
 
 
680 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  29.62 
 
 
694 aa  144  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.59 
 
 
991 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  34.63 
 
 
649 aa  143  8e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 
669 aa  143  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 
953 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  30.03 
 
 
2327 aa  140  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  28.99 
 
 
1056 aa  140  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  40.22 
 
 
190 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  28.65 
 
 
708 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.45 
 
 
667 aa  139  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  26.17 
 
 
1488 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  33.33 
 
 
1228 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  24.51 
 
 
1050 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 
857 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
1088 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  25.87 
 
 
686 aa  130  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  27.63 
 
 
1128 aa  129  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  29.05 
 
 
1212 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  30.15 
 
 
1238 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 
1261 aa  128  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  26.92 
 
 
782 aa  128  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 
469 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 
1060 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  24.45 
 
 
1106 aa  127  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
1054 aa  123  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  26.38 
 
 
1611 aa  121  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 
1313 aa  120  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
1283 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  28.83 
 
 
1266 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  24.35 
 
 
1185 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 
1028 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  35.71 
 
 
2413 aa  114  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 
837 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  31.09 
 
 
828 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  28.72 
 
 
1009 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 
966 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  26.28 
 
 
963 aa  110  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
1119 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  26.29 
 
 
1125 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  26.33 
 
 
985 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  33.44 
 
 
1123 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  23.86 
 
 
828 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  30.64 
 
 
1676 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 
639 aa  107  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
937 aa  107  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.39 
 
 
968 aa  106  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
577 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  31.74 
 
 
1914 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  23.26 
 
 
807 aa  103  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  28.83 
 
 
809 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>