70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1484 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  768    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  57.27 
 
 		 669 aa  325  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  51.84 
 
 		 675 aa  310  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  44.93 
 
 		 379 aa  245  8e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  41.27 
 
 		 560 aa  233  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  47.35 
 
 		 938 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  40.05 
 
 		 713 aa  202  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  44.72 
 
 		 960 aa  202  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  43.71 
 
 		 728 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  42.52 
 
 		 1001 aa  189  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  41.64 
 
 		 581 aa  186  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  40.3 
 
 		 685 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  39.02 
 
 		 679 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  38.91 
 
 		 971 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  35.61 
 
 		 448 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  48.4 
 
 		 658 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3727  hypothetical protein  34.64 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  32.6 
 
 		 1202 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  30.07 
 
 		 815 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  33.53 
 
 		 771 aa  123  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  31.15 
 
 		 819 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3324  hypothetical protein  31.27 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0125921  normal  0.0119157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3268  hypothetical protein  30.82 
 
 		 329 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0855187 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  31.69 
 
 		 403 aa  110  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  28.96 
 
 		 1042 aa  98.6  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  27.37 
 
 		 769 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  27.27 
 
 		 1279 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  25.25 
 
 		 1361 aa  82.8  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  29.22 
 
 		 996 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0492  hypothetical protein  31.01 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.652654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0494  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  33.87 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  28.29 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.06 
 
 		 446 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  23.87 
 
 		 430 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  23.87 
 
 		 430 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  27.64 
 
 		 444 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 446 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0446  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.97 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0119  translocation protein TolB  28.37 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.000000000125322  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0147  translocation protein TolB  27.66 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000145725  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0107  translocation protein TolB  27.66 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.133002  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  23.04 
 
 		 449 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  32.94 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  24.51 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  31.76 
 
 		 567 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  25.76 
 
 		 1167 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  20.53 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  31.96 
 
 		 1042 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  30.21 
 
 		 1040 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.98 
 
 		 407 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  22.51 
 
 		 449 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  27.64 
 
 		 450 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1520  translocation protein TolB  38.98 
 
 		 421 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368707  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  29.17 
 
 		 1042 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  21.16 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  25 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  28.39 
 
 		 572 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  24.62 
 
 		 615 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0495  hypothetical protein  26.85 
 
 		 126 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  26 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  26.02 
 
 		 450 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  31.11 
 
 		 439 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  27.52 
 
 		 445 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4016  WD40 domain protein beta Propeller  31.53 
 
 		 169 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392857 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1859  hypothetical protein  23.08 
 
 		 529 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.956553 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  26.53 
 
 		 433 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4587  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  23.85 
 
 		 410 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627226  normal  0.707851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  26.53 
 
 		 423 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  26.53 
 
 		 423 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  26.02 
 
 		 462 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>